RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 A8MU76 341 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 GPR182O15218 404 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 TPST2O60704 377 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 APOC3P02656 99 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 HDCP19113 662 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 NPR2P20594 1047 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 CPN2P22792 545 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 S100A2P29034 98 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 LCN1P31025 176 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 MANFP55145 182 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 ABRQ12979 859 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 GTF2H2Q13888 395 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 GNA13Q14344 377 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 GANABQ14697 944 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 GRIK4Q16099 956 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 OCLNQ16625 522 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 HECTD3Q5T447 861 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 ARMC6Q6NXE6 501 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 OOSP2Q86WS3 158 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 MARCH9Q86YJ5 346 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 S100PBPQ96BU1 408 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 COL21A1Q96P44 957 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 ERVK13-1Q9NX77 482 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 MAT2BQ9NZL9 334 aa9.65□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 SHPRHQ149N8 1683 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 MEGF6O75095 1541 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 C2CD4BA6NLJ0 364 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 H0YJX3 145 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 DLGAP1O14490 977 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 NME6O75414 186 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 RASAL1O95294 804 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 ANXA8P13928 327 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 CNTN2Q02246 1040 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 DSC3Q14574 896 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 RELL1Q8IUW5 271 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 FUZQ9BT04 418 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 MAF1Q9H063 256 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 IL1RAPQ9NPH3 570 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 GIMAP2Q9UG22 337 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 FAM86C2PA6NEL3 165 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 E9PAM4 449 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 H0YAE9 185 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 CILPO75339 1184 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 RFPL1O75677 317 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 IMPDH1P20839 514 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 THPOP40225 353 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 FNTBP49356 437 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 DGKEP52429 567 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 PITPNAQ00169 270 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 SYVN1Q86TM6 617 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 CFAP206Q8IYR0 622 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 LGI4Q8N135 537 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 ZUFSPQ96AP4 578 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 IDI2Q9BXS1 227 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 FKBP14Q9NWM8 211 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 GULP1Q9UBP9 304 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 CEPT1Q9Y6K0 416 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 IGSF6O95976 241 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 CFHP08603 1231 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 ARL4DP49703 201 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 PPP5CP53041 499 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 HERVK_113P63132 956 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 KCNJ8Q15842 424 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 TATDN1Q6P1N9 297 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 DNERQ8NFT8 737 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 FAM129BQ96TA1 746 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 ERVK-6Q9BXR3 956 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 TM6SF2Q9BZW4 377 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 MYOZ2Q9NPC6 264 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 HCN2Q9UL51 889 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 KAT6AQ92794 2004 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 NFASCO94856 1347 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 NARSO43776 548 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 STK16O75716 305 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 GJB1P08034 283 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 PFKPQ01813 784 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 ADAM15Q13444 863 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 HSDL1Q3SXM5 330 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 SLC39A12Q504Y0 691 aa9.64□□□□□ -0.87
HERC3-202ENST00000402738 SNAP47Q5SQN1 464 aa9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.9 ms