RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRYBG2Q8N1P7 616 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTC30BQ8N4P2 665 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPDL1Q96EA4 605 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ST6GAL2Q96JF0 529 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF354BQ96LW1 612 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 C17orf77Q96MU5 243 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEPHS2Q99611 448 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 EPYCQ99645 322 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 AP1M1Q9BXS5 423 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 WNT5BQ9H1J7 359 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 OPA3Q9H6K4 179 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 OLAHQ9NV23 265 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM118AQ9NWS6 357 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTTG2Q9NZH5 202 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC24A2Q9UI40 661 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 NME7Q9Y5B8 376 aa2.55□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A1W2PRB8 838 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM172BPA6NC97 362 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 BMPR1BO00238 502 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR10H2O60403 315 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 DIAPH2O60879 1101 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TADA2AO75478 443 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TOMM70O94826 608 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 APOA4P06727 396 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACP2P11117 423 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 GNAZP19086 355 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 MSH3P20585 1137 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCGF2P35227 344 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 NR2C2P49116 596 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAB28P51157 221 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDX1P52945 283 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CX3CL1P78423 397 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARL16Q0P5N6 197 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CRY2Q49AN0 593 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 MDH1BQ5I0G3 518 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRBOX4Q5JUW0 171 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 C1orf141Q5JVX7 400 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARMC4Q5T2S8 1044 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 STPG1Q5TH74 334 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CST9LP1Q5W188 147 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 C19orf48Q6RUI8 117 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CFAP206Q8IYR0 622 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CEP57L1Q8IYX8 460 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 XXYLT1Q8NBI6 393 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATL1Q8WXF7 558 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLAMF9Q96A28 289 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 VPS33AQ96AX1 596 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF653Q96CK0 615 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 HDAC11Q96DB2 347 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 RMDN1Q96DB5 314 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 RADILQ96JH8 1075 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CFAP57Q96MR6 1250 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SFXN2Q96NB2 322 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 UHRF2Q96PU4 802 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR10A4Q9H209 315 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACKR4Q9NPB9 350 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZFP57Q9NU63 452 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 OSGIN1Q9UJX0 560 aa2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMCHD1A6NHR9 2005 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 FEZF1A0PJY2 475 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 URADA6NGE7 173 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 A8MXE2 369 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRR32B1ATL7 298 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 P2RY10O00398 339 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 LMX1BO60663 402 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBX10O75333 385 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC22A3O75751 556 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF432O94892 652 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLCO2B1O94956 709 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 DANCRP0C864 163 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 FGF5P12034 268 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 EPHA2P29317 976 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC6A6P31641 620 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAD23AP54725 363 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PHEXP78562 749 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAMK2DQ13557 499 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTPRCAPQ14761 206 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 PSMD6Q15008 389 aa2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELFN2Q5R3F8 820 aa2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms