RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340074.9

UBE3B-201, Transcript of ubiquitin protein ligase E3B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE3B, Length 1,448 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3B-201ENST00000340074 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa14.87□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 SLC24A2Q9UI40 661 aa14.87□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 IGF2RP11717 2491 aa14.87□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.87□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 CCDC187A0A096LP49 1063 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 H3BMM5 538 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 HAUS5O94927 633 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 CAPNS1P04632 268 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 APOA4P06727 396 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 CHRM3P20309 590 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 CAV1Q03135 178 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 CNSTQ6PJW8 725 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 RAB11FIP2Q7L804 512 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 ZFPM2Q8WW38 1151 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 SLC17A6Q9P2U8 582 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 ASF1AQ9Y294 204 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 PCM1Q15154 2024 aa14.86□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 A8MU76 341 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 E5RI56 91 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 KPNA5O15131 536 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 BRINP1O60477 761 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 SLCO2B1O94956 709 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 NDUFS1P28331 727 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 CAPZBP47756 277 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 LSSP48449 732 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 CARSP49589 748 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 GFERP55789 205 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 GUCY2DQ02846 1103 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 PRKG2Q13237 762 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 C16orf72Q14CZ0 275 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 TMED2Q15363 201 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 ZNF549Q6P9A3 640 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 PLXDC1Q8IUK5 500 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 CNTN4Q8IWV2 1026 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 FBXO39Q8N4B4 442 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 CEP112Q8N8E3 955 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 ACVR1CQ8NER5 493 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 OR5AR1Q8NGP9 310 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 SEC14L1Q92503 715 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 HGH1Q9BTY7 390 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 CCDC68Q9H2F9 335 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 SAYSD1Q9NPB0 183 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 PDP2Q9P2J9 529 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 GALPQ9UBC7 116 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 KLHL3Q9UH77 587 aa14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 C9P02748 559 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 HGFP14210 728 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 KLHL35Q6PF15 583 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 CAPN12Q6ZSI9 719 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 TGM7Q96PF1 710 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 NRTNQ99748 197 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 CMKLR1Q99788 373 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 LOXL2Q9Y4K0 774 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 ZFHX4Q86UP3 3567 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 ACACAQ13085 2346 aa14.84□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 TMEM8BA6NDV4 472 aa14.83□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 PLD2O14939 933 aa14.83□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 AHSGP02765 367 aa14.83□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 GABRB3P28472 473 aa14.83□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 SSTR1P30872 391 aa14.83□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 PPP1CAP62136 330 aa14.83□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 ABRQ12979 859 aa14.83□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 IRGCQ6NXR0 463 aa14.83□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 KIAA0408Q6ZU52 694 aa14.83□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa14.83□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 CCDC25Q86WR0 208 aa14.83□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 PALM2Q8IXS6 379 aa14.83□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 TBC1D21Q8IYX1 336 aa14.83□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 ZBTB2Q8N680 514 aa14.83□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 OR4E2Q8NGC2 313 aa14.83□□□□□ -0.03
UBE3B-201ENST00000340074 OR5K2Q8NHB8 316 aa14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms