RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328834.9

CNOT10-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT10, Length 2,815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT10-201ENST00000328834 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 GMEB1Q9Y692 573 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 MTMR11A4FU01 709 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 ANKRD66B4E2M5 251 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 AGRPO00253 132 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 ANKRD28O15084 1053 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 SEC22BO75396 215 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 FCGR1AP12314 374 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 HTR7P34969 479 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 CDKN2CP42773 168 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 PHC1P78364 1004 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 SBSNQ6UWP8 590 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 COLGALT2Q8IYK4 626 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 TSSK3Q96PN8 268 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 MGME1Q9BQP7 344 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 ACTR8Q9H981 624 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 FUOMA2VDF0 154 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 ATF6P18850 670 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 GGT1P19440 569 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 CLCN7P51798 805 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 VAC14Q08AM6 782 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 THAP5Q7Z6K1 395 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 CD320Q9NPF0 282 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 SACM1LQ9NTJ5 587 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 RIC8BQ9NVN3 520 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 SEPT3Q9UH03 358 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 CDH7Q9ULB5 785 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 FFAR2O15552 330 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 SERPINA1P01009 418 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 RHOCP08134 193 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 RAP2AP10114 183 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 TYMPP19971 482 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 TACR1P25103 407 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 TRAF3Q13114 568 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 DNASE1L3Q13609 305 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 GTF2H3Q13889 308 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 CRY1Q16526 586 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 BROXQ5VW32 411 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 CST9Q5W186 159 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 GRAMD4Q6IC98 578 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 RFLNAQ6ZTI6 216 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 NDNFQ8TB73 568 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 WFDC5Q8TCV5 224 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 GTF2H4Q92759 462 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 GLTPD2A6NH11 291 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 H3BNC9 293 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 hCG_2039718K7EN88 272 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 ADAM23O75077 832 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 ZNF682O95780 498 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 GLUD1P00367 558 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 VBP1P61758 197 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 ARF5P84085 180 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 IL5RAQ01344 420 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 CYP4F3Q08477 520 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 BORCS5Q969J3 196 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 PSKH2Q96QS6 385 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 DOK1Q99704 481 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 FEM1AQ9BSK4 669 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 PRM3Q9NNZ6 103 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 MRGBPQ9NV56 204 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 ZNF639Q9UID6 485 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 C2orf78A6NCI8 922 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 TMEM247A6NEH6 219 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 OAZ2O95190 189 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 CD160O95971 181 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 MAGP20916 626 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT10-201ENST00000328834 FOXM1Q08050 763 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms