RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 CDKAL1Q5VV42 579 aa11.7□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM131AQ6UXB0 335 aa11.7□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM71AQ8IYT1 594 aa11.7□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 HIC2Q96JB3 615 aa11.7□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF570Q96NI8 536 aa11.7□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 TRIM39Q9HCM9 518 aa11.7□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 TMCO1Q9UM00 188 aa11.7□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 DGKBQ9Y6T7 804 aa11.7□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 ST3GAL1Q11201 340 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 GPR107Q5VW38 600 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 ABHD13Q7L211 337 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 FOXRED2Q8IWF2 684 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 LRRC52Q8N7C0 313 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 PHC3Q8NDX5 983 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 SNX27Q96L92 541 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM129BQ96TA1 746 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 COPG2Q9UBF2 871 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 TAC3Q9UHF0 121 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1B0GVT2 93 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 PLIN3O60664 434 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 WFS1O76024 890 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 LRIG2O94898 1065 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 TYRP14679 529 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 SUSD1Q6UWL2 747 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 OR13C4Q8NGS5 318 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 MFSD3Q96ES6 412 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 SMURF1Q9HCE7 757 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 SATB2Q9UPW6 733 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 COL1A2P08123 1366 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 FKBP6O75344 327 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 ACADLP28330 430 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 KCNQ1P51787 676 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 SMIM11AP58511 58 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 ELOA3BQ3SY89 546 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 SFRP1Q8N474 314 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 ELOA3Q8NG57 546 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF39Q9H2S5 420 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 H3BQ06 376 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 SYN3O14994 580 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 PDPK1O15530 556 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 TEX44Q53QW1 395 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 DHDDSQ86SQ9 333 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 KLK1P06870 262 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 TSPAN5P62079 268 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 CDKL1Q00532 357 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 MYDGFQ969H8 173 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 PLD4Q96BZ4 506 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 CLPTM1LQ96KA5 538 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 HMGXB4Q9UGU5 601 aa11.69□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 PLD2O14939 933 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 AP5Z1O43299 807 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 STK16O75716 305 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 NDST3O95803 873 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 FHP07954 510 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 PLEKHG6Q3KR16 790 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF615Q8N8J6 731 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 C11orf65Q8NCR3 313 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 TLR10Q9BXR5 811 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 PCYOX1Q9UHG3 505 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 YJEFN3A6XGL0 299 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 E7ENQ6 273 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 CDH12P55289 794 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 BST1Q10588 318 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 NNATQ16517 81 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 ARSHQ5FYA8 562 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 LDLRAP1Q5SW96 308 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 TPRG1Q6ZUI0 275 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 GKN2Q86XP6 184 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 STYXQ8WUJ0 223 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 WNT9AO14904 365 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 OAZ2O95190 189 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 RPP38P78345 283 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 PON2Q15165 354 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 OR7A2PQ8NGA2 310 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 MIOSQ9NXC5 875 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 PDP2Q9P2J9 529 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 YIPF1Q9Y548 306 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 ACTR3P61158 418 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC34A1Q06495 639 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 MZT2BQ6NZ67 158 aa11.68□□□□□ -0.54
UBASH3B-201ENST00000284273 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms