RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF234Q14588 700 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 VSTM1Q6UX27 236 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 NAPRTQ6XQN6 538 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 RENP00797 406 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 ITGB5P18084 799 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 HYAL2Q12891 473 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 PIP5K1BO14986 540 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 GSC2O15499 205 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 POP4O95707 220 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 ITGB1P05556 798 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 LINGO3P0C6S8 592 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 KHKP50053 298 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 FUT10Q6P4F1 479 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 GPR20Q99678 358 aa20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 NWD1Q149M9 1564 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 NUDT17P0C025 328 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 DMRTB1Q96MA1 342 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 PTPN2P17706 415 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF311Q5JNZ3 666 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 SLC51AQ86UW1 340 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 LHX5Q9H2C1 402 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 AIREO43918 545 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 ALPPP05187 535 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 TMEM145Q8NBT3 493 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 MFSD3Q96ES6 412 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 CD48P09326 243 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 MTTPP55157 894 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 C1orf216Q8TAB5 229 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 PEX10O60683 326 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 CAPZA1P52907 286 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 HSDL1Q3SXM5 330 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 ADNP2Q6IQ32 1131 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 ABCB8Q9NUT2 735 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 NOX1Q9Y5S8 564 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 ARL5AQ9Y689 179 aa20.16■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 A8MU76 341 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 SLC7A1P30825 629 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 OR3A3P47888 321 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 OR3A2P47893 321 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 TAS2R50P59544 299 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 SUN3Q8TAQ9 357 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 TESCQ96BS2 214 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 KERAO60938 352 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 ACRP10323 421 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 TPSB2P20231 275 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 TPSAB1Q15661 275 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 SLC1A5Q15758 541 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 CBR4Q8N4T8 237 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 PNPLA8Q9NP80 782 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 TELO2Q9Y4R8 837 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 TIE1P35590 1138 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 RPS9P46781 194 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF554Q86TJ5 538 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 UFD1Q92890 307 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 GORASP1Q9BQQ3 440 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 AXIN1O15169 862 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 FAM92BQ6ZTR7 304 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 FRMD7Q6ZUT3 714 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 ECHDC2Q86YB7 292 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 PSMG2Q969U7 264 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 CCDC120Q96HB5 630 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 CALML5Q9NZT1 146 aa20.15■□□□□ 0.82
ZBED3-201ENST00000255198 DAPL1A0PJW8 107 aa20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms