RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 OR52A5Q9H2C5 316 aa20.47■□□□□ 0.87
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NEDD8-201ENST00000250495 MVB12BQ9H7P6 319 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC40Q9H9A6 602 aa20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 HECTD1Q9ULT8 2610 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 GSAPA4D1B5 854 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 SPTBP11277 2137 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 TPH1P17752 444 aa20.46■□□□□ 0.87
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NEDD8-201ENST00000250495 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
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NEDD8-201ENST00000250495 P3H1Q32P28 736 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 IZUMO3Q5VZ72 239 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 KIAA1328Q86T90 577 aa20.46■□□□□ 0.87
NEDD8-201ENST00000250495 SYCE1Q8N0S2 351 aa20.46■□□□□ 0.87
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NEDD8-201ENST00000250495 RUFY1Q96T51 708 aa20.46■□□□□ 0.87
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NEDD8-201ENST00000250495 RPS18P62269 152 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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NEDD8-201ENST00000250495 CHST8Q9H2A9 424 aa20.45■□□□□ 0.86
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NEDD8-201ENST00000250495 BTN3A3O00478 584 aa20.44■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 RAB40ALP0C0E4 278 aa20.44■□□□□ 0.86
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NEDD8-201ENST00000250495 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
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NEDD8-201ENST00000250495 AMIGO1Q86WK6 493 aa20.44■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 DSELQ8IZU8 1212 aa20.44■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.44■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 C2orf74A8MZ97 194 aa20.43■□□□□ 0.86
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NEDD8-201ENST00000250495 CLDN19Q8N6F1 224 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 NLNQ9BYT8 704 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM55Q9BYV6 548 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 PITPNM3Q9BZ71 974 aa20.43■□□□□ 0.86
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NEDD8-201ENST00000250495 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
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NEDD8-201ENST00000250495 ST6GAL1P15907 406 aa20.42■□□□□ 0.86
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NEDD8-201ENST00000250495 OR1L3Q8NH93 324 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 MIB2Q96AX9 1013 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa20.42■□□□□ 0.86
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NEDD8-201ENST00000250495 TMEM121Q9BTD3 319 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 SNX7Q9UNH6 387 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 PLAAQ9Y263 795 aa20.42■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 PTPN13Q12923 2485 aa20.41■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 MROH6A6NGR9 719 aa20.41■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 ARGFXA6NJG6 315 aa20.41■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 HBQ1P09105 142 aa20.41■□□□□ 0.86
NEDD8-201ENST00000250495 PSMA3P25788 255 aa20.41■□□□□ 0.86
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