RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 ANPEPP15144 967 aa23.45■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 VHLP40337 213 aa23.45■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF423Q2M1K9 1284 aa23.45■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 TTC23LQ6PF05 361 aa23.45■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa23.45■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 CYP2U1Q7Z449 544 aa23.45■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 MCOLN3Q8TDD5 553 aa23.45■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa23.45■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 S100A14Q9HCY8 104 aa23.45■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 AIG1Q9NVV5 245 aa23.45■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR45Q9Y5Y3 372 aa23.45■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 ST14Q9Y5Y6 855 aa23.45■■□□□ 1.35
RPUSD1-201ENST00000007264 DOCK8Q8NF50 2099 aa23.45■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 SPINT1O43278 529 aa23.45■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 BAG2O95816 211 aa23.45■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 DPP6P42658 865 aa23.45■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 IL12RB1P42701 662 aa23.45■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 HNMTP50135 292 aa23.45■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 GRIK2Q13002 908 aa23.45■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 CES5AQ6NT32 575 aa23.45■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 NUDT18Q6ZVK8 323 aa23.45■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa23.45■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM159Q96B96 161 aa23.45■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 NUS1Q96E22 293 aa23.45■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC32A1Q9H598 525 aa23.45■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa23.45■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 PLK4O00444 970 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 EBLN1P0CF75 366 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 GCKP35557 465 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 HTR6P50406 440 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 CEACAM7Q14002 265 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 FLOT2Q14254 428 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 NR6A1Q15406 480 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 C6orf136Q5SQH8 315 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 LAYNQ6UX15 382 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 HOMEZQ8IX15 550 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 RNF148Q8N7C7 305 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 PYDC1Q8WXC3 89 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 ROPN1LQ96C74 230 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 ANKRD27Q96NW4 1050 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 MYADMQ96S97 322 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 C1orf50Q9BV19 199 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 NTMT1Q9BV86 223 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 CROTQ9UKG9 612 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 NDUFAF1Q9Y375 327 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRK1Q38SD2 2015 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 AREL1O15033 823 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 TSPAN6O43657 245 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 HACD2Q6Y1H2 254 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 PPFIBP2Q8ND30 876 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 HBEGFQ99075 208 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 SPAG4Q9NPE6 437 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 TRPS1Q9UHF7 1281 aa23.44■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 GFYI3L273 518 aa23.43■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 C6P13671 934 aa23.43■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 GDI1P31150 447 aa23.43■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 GGT5P36269 586 aa23.43■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 PSMD8P48556 350 aa23.43■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 PRLHRP49683 370 aa23.43■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 CTSCP53634 463 aa23.43■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 AP1S2P56377 157 aa23.43■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNK10P57789 538 aa23.43■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 ABRAXAS2Q15018 415 aa23.43■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 MUM1Q2TAK8 710 aa23.43■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 VPS26BQ4G0F5 336 aa23.43■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 Q6ZSR9 355 aa23.43■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa23.43■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 ERLEC1Q96DZ1 483 aa23.43■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 CCM2Q9BSQ5 444 aa23.43■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIM38O00635 465 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 FFAR3O14843 346 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR42O15529 346 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 MMP20O60882 483 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 SLCO2B1O94956 709 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 GRIA2P42262 883 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 GPR1P46091 355 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 RAET1GQ6H3X3 334 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF765Q7L2R6 523 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 ELSPBP1Q96BH3 223 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 BRINP2Q9C0B6 783 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 ACTR8Q9H981 624 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 KLQ9UEF7 1012 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 LOC730098B7Z3J9 87 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC22A3O75751 556 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 APODP05090 189 aa23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM220Q6QAJ8 160 aa23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms