RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ly6kQ9CWP4 154 aa20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dusp26Q9D700 211 aa20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pop5Q9DB28 169 aa20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aff4Q9ESC8 1160 aa20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 VapaQ9WV55 249 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc25a14Q9Z2B2 325 aa20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SmoktcrA2KF29 484 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dlx2P40764 332 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp324Q78F42 583 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rmdn2Q8BSE0 410 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CenpiQ8K1K4 746 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Unc5aQ8K1S4 898 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Capn8Q91VA3 703 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smg9Q9DB90 520 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rpn2Q9DBG6 631 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Osbpl10S4R1M9 766 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igkv10-94A0A075B5L1 115 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm14459A2BI73 179 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf165E9QAU8 347 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam181aJ3QNB7 292 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 VegfcP97953 415 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 A630001G21RikQ3UTB2 229 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 H2-Q2Q4KN81 360 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rab26Q504M8 260 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ranbp10Q6VN19 620 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf668Q8K2R5 619 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Uts2rQ8VIH9 385 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rmnd5bQ91YQ7 393 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr704Q9EPF6 315 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Snap29Q9ERB0 260 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Htr3bQ9JHJ5 437 aa20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rfc2Q9WUK4 349 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zdbf2Q5SS00 2493 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr566A0A1B0GST0 319 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 1600015I10RikE9Q745 711 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Esr1P19785 599 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Btbd1P58544 488 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gdf3Q07104 366 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pfdn4Q3UWL8 134 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Usp22Q5DU02 525 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trpc1Q61056 793 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CilpQ66K08 1184 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pwwp2aQ69Z61 730 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Casd1Q7TN73 797 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dsg1bQ7TSF1 1060 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 StgQ8BM15 349 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gjc2Q8BQU6 440 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4931406P16RikQ8C5X1 1059 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mterf1aQ8CHZ9 379 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nckap1lQ8K1X4 1134 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ssh3Q8K330 649 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr677Q8VF06 312 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aim2Q91VJ1 354 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MvdQ99JF5 401 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pgm3Q9CYR6 542 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AicdaQ9WVE0 198 aa20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm13285B1AYI3 182 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm13275B1AYI8 182 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rrn3B2RS91 656 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam124aD3Z5V4 536 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kbtbd6E9PYD7 486 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm4847G3X946 537 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kbtbd7G5E8C2 690 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cbx4O55187 551 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ctla2bP12400 113 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CremP27699 357 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Serpina3cP29621 417 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nudt1P53368 156 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc16a1P53986 493 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NadkP58058 439 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PamP97467 979 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abraxas2Q3TCJ1 415 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cog7Q3UM29 770 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itga2Q62469 1178 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pcdhga7Q6DD96 935 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ddx51Q6P9R1 639 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr735Q7TRM4 354 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp1r15bQ8BFW3 697 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 IfnzQ8BQT1 182 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ifi44Q8BV66 422 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm13278Q8CD73 182 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Snx8Q8CFD4 459 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rsph1Q8VIG3 301 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TsaccQ9DA44 124 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 VarsQ9Z1Q9 1263 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem215A7E1Z1 235 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Armc4B2RY50 1037 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmn2r116E9Q6I0 856 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RbpjlO08674 515 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 St3gal5O88829 414 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tead2P48301 445 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cntn5P68500 1098 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gjb5Q02739 271 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tnks2Q3UES3 1166 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf220Q6PDX6 566 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fut11Q8BHC9 489 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Crtc3Q91X84 619 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trim12aQ99PQ1 284 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bcl7aQ9CXE2 210 aa20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dcdc2cQ9D1B8 347 aa20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.3 ms