RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ChatQ03059 641 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Emx2Q04744 253 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Alg6Q3TAE8 507 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp868Q3UTQ6 422 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adrbk2Q3UYH7 688 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdkn2cQ60772 168 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kir3dl2Q673W2 388 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ddx51Q6P9R1 639 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SyncripQ7TMK9 623 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trmt2bQ8BQJ6 493 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slco3a1Q8R3L5 710 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1310Q8VF85 312 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PxnQ8VI36 591 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tspan1Q99J59 240 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Haus8Q99L00 373 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nudt7Q99P30 236 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gid8Q9D7M1 228 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Aff4Q9ESC8 1160 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Noa1Q9JJG9 693 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sae1Q9R1T2 350 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ArntlQ9WTL8 632 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Chek2Q9Z265 546 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RgrQ9Z2B3 291 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lgr4A2ARI4 951 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 A6H6Q4 206 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kif6E9PX57 802 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Erich2E9Q1A6 463 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spdye4cI6XKQ3 339 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dgcr6O35347 198 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lhx8O35652 367 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cbx4O55187 551 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pdlim1O70400 327 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 JunbP09450 344 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hspa4lP48722 838 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nat1P50294 290 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lman2lP59481 347 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Snrpd1P62315 119 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Htr4P97288 388 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 DmwdQ08274 665 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem173Q3TBT3 378 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spata6Q3U6K5 488 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PtprnQ60673 979 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Runx3Q64131 409 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ca4Q64444 305 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc13a5Q67BT3 572 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcdhga7Q6DD96 935 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpr141Q7TQP0 305 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q810N5 247 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ankrd9Q8BH83 326 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CenpiQ8K1K4 746 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tspan14Q8QZY6 270 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 IlkapQ8R0F6 392 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AcmsdQ8R519 336 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dennd2dQ91VV4 469 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rbm47Q91WT8 590 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Itfg1Q99KW9 610 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spz1Q99MY0 378 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Scd3Q99PL7 359 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Akr1a1Q9JII6 325 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Clec1bQ9JL99 229 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CroccQ8CJ40 2009 aa10.05□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Plxna2P70207 1894 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Myo7aP97479 2215 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zscan4bE9Q3G0 505 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rnf165E9QAU8 347 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r112L7N221 857 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rgs4O08899 205 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Matn4O89029 624 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cdh1P09803 884 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gja1P23242 382 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AcadsQ07417 412 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rbm15Q0VBL3 962 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam47cQ14BE7 430 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mks1Q5SW45 561 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pde1aQ61481 565 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ablim3Q69ZX8 682 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bfsp2Q6NVD9 416 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Scn4bQ7M729 228 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1036Q7TR85 310 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr792Q7TRH9 311 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr295Q7TS08 309 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmtc4Q8BG19 741 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrrc8dQ8BGR2 859 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcns3Q8BQZ8 491 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Arhgap19Q8BRH3 494 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kctd11Q8K485 232 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn1r185Q8R299 319 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Uts2rQ8VIH9 385 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mrgpra2Q91WW4 305 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Taf11Q99JX1 211 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nck1Q99M51 377 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ClpsQ9CQC2 113 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr704Q9EPF6 315 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nufip1Q9QXX8 484 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 VapaQ9WV55 249 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PcntP48725 2898 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem233D3Z1U7 110 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Il4i1O09046 630 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sult3a1O35403 293 aa10.04□□□□□ -0.8
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ptch2O35595 1182 aa10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.2 ms