RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001711.5

Hoxc6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc6, Length 1,581 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 MyogP12979 224 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 MaxP28574 160 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 DctP29812 517 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Klk1b26P36369 261 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fdft1P53798 416 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 GuloP58710 440 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dlx5P70396 289 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rpl10lP86048 214 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tie1Q06806 1134 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm4981Q3ULJ8 291 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rpl10Q6ZWV3 214 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Med26Q7TN02 588 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 DdnQ80TS7 710 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pcmtd2Q8BHD8 359 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Clptm1lQ8BXA5 539 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zfpm2Q8CCH7 1151 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sugp1Q8CH02 643 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pkn3Q8K045 878 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lrrc25Q8K1T1 297 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 FancgQ9EQR6 623 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Scamp4Q9JKV5 230 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 RpgrQ9R0X5 1001 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Psmd13Q9WVJ2 376 aa18.25■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pcna-ps2A0A140T8V5 261 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Calcoco2A2A6M5 331 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Trgv2A2J008 116 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fam71f2B2RXB0 297 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr891E9Q843 316 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Taf4E9QAP7 1042 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 A630095N17RikJ3KMM7 116 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rgs4O08899 205 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mkln1O89050 735 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fcgr2P08101 330 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fcgr3P08508 261 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 EnpepP16406 945 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hoxa2P31245 372 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kcnj13P86046 360 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Atp8b1Q148W0 1251 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kcnh6Q32ME0 950 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Trafd1Q3UDK1 580 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ntrk1Q3UFB7 799 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Spata24Q6P926 205 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ubtd2Q6PGH0 234 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tas2r38Q7TQA6 331 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr664Q7TRP5 306 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 C1qtnf7Q8BVD7 289 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc45a3Q8K0H7 553 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mrps18cQ8R2L5 143 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lrrc26Q91W20 331 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Alg1Q921Q3 482 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pmf1Q9CPV5 202 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mrpl57Q9CQF8 102 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mrps9Q9D7N3 390 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cldn22Q9D7U6 220 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kcne2Q9D808 123 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr704Q9EPF6 315 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 SqorQ9R112 450 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Atp6ap1Q9R1Q9 463 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 ArntlQ9WTL8 632 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Usp18Q9WTV6 368 aa18.24■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm15821A6X8J8 139 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Skint1A7TZE6 364 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hsf3D0VYS2 492 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr726E9Q8X3 321 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc27a2O35488 620 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 MdkP12025 140 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Eno3P21550 434 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Csrp3P50462 194 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Csrp2P97314 193 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr725Q05A45 321 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Bcl2a1Q07440 172 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Riiad1Q3KNY5 119 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mep1bQ61847 704 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fgfr3Q61851 801 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lrrc8eQ66JT1 795 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cachd1Q6PDJ1 1288 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Kif18bQ6PFD6 834 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gstm7Q80W21 218 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mospd3Q8BGG6 235 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mptx1Q8R1M8 219 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Neto1Q8R4I7 533 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr1093Q8VF14 322 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rab28Q99KL7 221 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zmynd10Q99ML0 440 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Trim33Q99PP7 1142 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sohlh2Q9D489 467 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cbll1Q9JIY2 491 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ccr10Q9JL21 362 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 PrepQ9QUR6 710 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fiz1Q9WTJ4 500 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 LipgQ9WVG5 500 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Krt6bQ9Z331 562 aa18.23■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tmem236A2ARJ3 344 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zscan4bE9Q3G0 505 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm29394H3BIW7 199 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Wisp1O54775 367 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 P01669 111 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nt5c3bQ3UFY7 300 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr384Q7TRX8 312 aa18.22■□□□□ 0.51
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rccd1Q8BTU7 377 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 39.7 ms