RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641601.1

SAMMSON-218, survival associated mitochondrial melanoma specific oncogenic non-coding RNA, humanhuman

BASIC

Gene SAMMSON, Length 1,847 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMMSON-218ENST00000641601 PSME2Q9UL46 239 aa9.97□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa9.97□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa9.97□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC38A8A6NNN8 435 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 GSTA4O15217 222 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 RGS14O43566 566 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 WDR47O94967 919 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 VNN2O95498 520 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 BCL10O95999 233 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 IL6P05231 212 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 RETP07949 1114 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 COL6A1P12109 1028 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 UGT1A1P22309 533 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 UGT1A4P22310 534 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CST5P28325 142 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 UGT1A3P35503 534 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 UGT1A5P35504 534 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 DGKQP52824 942 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CYP4F3Q08477 520 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 C6orf141Q5SZD1 244 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 NCEH1Q6PIU2 408 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SPARTQ8N0X7 666 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF555Q8NEP9 628 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC22A17Q8WUG5 538 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 LINC01599Q8WXQ3 324 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 GTF2H4Q92759 462 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 PLD4Q96BZ4 506 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 GLT1D1Q96MS3 346 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 MBOAT4Q96T53 435 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 BEGAINQ9BUH8 593 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 CWH43Q9H720 699 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 IPPKQ9H8X2 491 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 VAPAQ9P0L0 249 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 IL17CQ9P0M4 197 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 NOD1Q9Y239 953 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 PKP3Q9Y446 797 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 OARD1Q9Y530 152 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa9.96□□□□□ -0.81
SAMMSON-218ENST00000641601 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 A0A1B0GVM2 712 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 ELOVL7A1L3X0 281 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 FFAR2O15552 330 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 DFNA5O60443 496 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 CST1P01037 141 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 NRIP1P48552 1158 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 BMXP51813 675 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 ARPP19P56211 112 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 RPS24P62847 133 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 TRAF2Q12933 501 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 BNIP3Q12983 259 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 IL18R1Q13478 541 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 MAPKAPK3Q16644 382 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 ANKDD1AQ495B1 522 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 ATG9BQ674R7 924 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 XKR5Q6UX68 686 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 ZNF783Q6ZMS7 281 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 TAS2R42Q7RTR8 314 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 TRIM46Q7Z4K8 759 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 MILR1Q7Z6M3 343 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 EFHBQ8N7U6 833 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 PDZD8Q8NEN9 1154 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 OVCA2Q8WZ82 227 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 TRIB2Q92519 343 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 SLC47A1Q96FL8 570 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 SMIM14Q96QK8 99 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 LHPPQ9H008 270 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 BPIFA1Q9NP55 256 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa9.96□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa9.95□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 SOBPA7XYQ1 873 aa9.95□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 H7C4K7 107 aa9.95□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 CBX4O00257 560 aa9.95□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 CXCR6O00574 342 aa9.95□□□□□ -0.82
SAMMSON-218ENST00000641601 TAPBPO15533 448 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms