RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 GLUD1P00367 558 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 HMGCLP35914 325 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 HLCSP50747 726 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 HMGCS1Q01581 520 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 CDKN3Q16667 212 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 ANKDD1AQ495B1 522 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 FGD3Q5JSP0 725 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 XAF1Q6GPH4 301 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 SLC8B1Q6J4K2 584 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 SUSD1Q6UWL2 747 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 ANKS3Q6ZW76 656 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 FRA10AC1Q70Z53 315 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 FAM126BQ8IXS8 530 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 ALG14Q96F25 216 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 C17orf80Q9BSJ5 609 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa13.12□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 GIPC1O14908 333 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 GREM1O60565 184 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 PRAMEF1O95521 474 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 MATN1P21941 496 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 GKP32189 559 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 ALDH3A2P51648 485 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 SMARCB1Q12824 385 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 LAPTM5Q13571 262 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 RNF180Q86T96 592 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 RNF217Q8TC41 542 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 SLC22A12Q96S37 553 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 VPS51Q9UID3 782 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 KANSL1LA0AUZ9 987 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 H0YAE9 185 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 B3GALT4O96024 378 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 COL6A1P12109 1028 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 OR1D2P34982 312 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 PIGAP37287 484 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 NEDD8Q15843 81 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 LAIR2Q6ISS4 152 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM150AQ86TG1 271 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 TTC16Q8NEE8 873 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 OR8J3Q8NGG0 315 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 SLC22A17Q8WUG5 538 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 SLC13A3Q8WWT9 602 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 FEM1AQ9BSK4 669 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 OSBPL6Q9BZF3 934 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 OARD1Q9Y530 152 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 H7C4K7 107 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 TULP3O75386 442 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 ANXA6P08133 673 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 RAP2AP10114 183 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 EPORP19235 508 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 GGT5P36269 586 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 TM4SF4P48230 202 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 DAG1Q14118 895 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 SLC44A4Q53GD3 710 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 ITFG1Q8TB96 612 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 BDH2Q9BUT1 245 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 TM6SF2Q9BZW4 377 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 MTRRQ9UBK8 725 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa13.11□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 GFRA2O00451 464 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 PGLSO95336 258 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 OTCP00480 354 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 HTR1AP08908 422 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 CSKP41240 450 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 PHC1P78364 1004 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 SPANXN4Q5MJ08 99 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 FAM117BQ6P1L5 589 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 PRR23BQ6ZRT6 265 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 ZSWIM9Q86XI8 627 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 PLPP6Q8IY26 295 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 STK40Q8N2I9 435 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 CARNMT1Q8N4J0 409 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 OR13F1Q8NGS4 319 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 OR10A6Q8NH74 314 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 MYO19Q96H55 970 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 GLT1D1Q96MS3 346 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 SMURF2Q9HAU4 748 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 MAGEE1Q9HCI5 957 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 IL26Q9NPH9 171 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 CIDEBQ9UHD4 219 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 STOML2Q9UJZ1 356 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 DYTNA2CJ06 578 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 AXIN1O15169 862 aa13.1□□□□□ -0.31
C9orf170-201ENST00000623052 TBL1XO60907 577 aa13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms