RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 HADHAP40939 763 aa21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 PLCL1Q15111 1095 aa21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 SNX20Q7Z614 316 aa21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 PPP1R3BQ86XI6 285 aa21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 RASGRP3Q8IV61 690 aa21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 HM13Q8TCT9 377 aa21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 C12orf66Q96MD2 445 aa21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 FCRL4Q96PJ5 515 aa21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 TWSG1Q9GZX9 223 aa21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 SLC24A2Q9UI40 661 aa21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 CRLS1Q9UJA2 301 aa21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa21.48■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 H7C0S8 307 aa21.48■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 KATNA1O75449 491 aa21.48■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 SPAG6O75602 509 aa21.48■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 CREG1O75629 220 aa21.48■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 SLC35G4P0C7Q5 338 aa21.48■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 RALBP11234 206 aa21.48■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 TUBB3Q13509 450 aa21.48■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 CARFQ8N187 725 aa21.48■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 TTC13Q8NBP0 860 aa21.48■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 NAT14Q8WUY8 206 aa21.48■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 HEXDCQ8WVB3 486 aa21.48■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 SEC14L1Q92503 715 aa21.48■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 MAP3K3Q99759 626 aa21.48■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa21.48■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 AMFRQ9UKV5 643 aa21.48■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 TIAF1O95411 115 aa21.47■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 MT-ND3P03897 115 aa21.47■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 PDGFAP04085 211 aa21.47■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 FOLR1P15328 257 aa21.47■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 DNASE1L3Q13609 305 aa21.47■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 GPR33Q49SQ1 333 aa21.47■■□□□ 1.03
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SRRT-218ENST00000620394 PEX26Q7Z412 305 aa21.47■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 TMEM135Q86UB9 458 aa21.47■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 OOSP2Q86WS3 158 aa21.47■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 SYCE1Q8N0S2 351 aa21.47■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 LRRC45Q96CN5 670 aa21.47■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 DCUN1D1Q96GG9 259 aa21.47■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 COPS8Q99627 209 aa21.47■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 PDE7BQ9NP56 450 aa21.47■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 RARRES3Q9UL19 164 aa21.47■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 SHANK1Q9Y566 2161 aa21.46■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa21.46■■□□□ 1.03
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SRRT-218ENST00000620394 C21orf140B9A014 251 aa21.46■■□□□ 1.03
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SRRT-218ENST00000620394 NDUFS1P28331 727 aa21.46■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 ACY1Q03154 408 aa21.46■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 SEMA5AQ13591 1074 aa21.46■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 SPARCL1Q14515 664 aa21.46■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 PARP6Q2NL67 630 aa21.46■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa21.46■■□□□ 1.03
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SRRT-218ENST00000620394 D2HGDHQ8N465 521 aa21.46■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 UBL4BQ8N7F7 174 aa21.46■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 SLC35B2Q8TB61 432 aa21.46■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 ELMO2Q96JJ3 720 aa21.46■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 CCM2Q9BSQ5 444 aa21.46■■□□□ 1.03
SRRT-218ENST00000620394 PIPSLA2A3N6 862 aa21.45■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 DNAJB5O75953 348 aa21.45■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 EBLN1P0CF75 366 aa21.45■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 PSMA3P25788 255 aa21.45■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 MC4RP32245 332 aa21.45■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 KCNAB1Q14722 419 aa21.45■■□□□ 1.02
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SRRT-218ENST00000620394 FAM71DQ8N9W8 422 aa21.45■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 RNF31Q96EP0 1072 aa21.45■■□□□ 1.02
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SRRT-218ENST00000620394 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 HRASLS2Q9NWW9 162 aa21.45■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa21.45■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 FAM8A1Q9UBU6 413 aa21.45■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 BTRCQ9Y297 605 aa21.45■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa21.45■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 CCL22O00626 93 aa21.44■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 METTL18O95568 372 aa21.44■■□□□ 1.02
SRRT-218ENST00000620394 ACRV1P26436 265 aa21.44■■□□□ 1.02
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