RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 PCDH18Q9HCL0 1135 aa8.57□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 SLAMF7Q9NQ25 335 aa8.57□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 POT1Q9NUX5 634 aa8.57□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 PKD2L2Q9NZM6 624 aa8.57□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 SEMA5BQ9P283 1151 aa8.57□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TRIM10Q9UDY6 481 aa8.57□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 EPHA6Q9UF33 1036 aa8.57□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.57□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 PCSK5Q92824 1860 aa8.57□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 POLEQ07864 2286 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 SPTBP11277 2137 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 LGALS16A8MUM7 142 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ZNF185O15231 689 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 MFSD11O43934 449 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 DPM1O60762 260 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 MTA2O94776 668 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 CBX6O95503 412 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 HLA-DQB2P05538 268 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ATP1A3P13637 1013 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 FERP16591 822 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 LPOP22079 712 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 SERPINB6P35237 376 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 PCK1P35558 622 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 RPS15P62841 145 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 GALNT2Q10471 571 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ZNF569Q5MCW4 686 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 FAM182AQ5T1J6 154 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 LCN10Q6JVE6 187 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 LRRTM4Q86VH4 590 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 SLC38A9Q8NBW4 561 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 GPR26Q8NDV2 337 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 GPR150Q8NGU9 434 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 SEC14L1Q92503 715 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 UBXN4Q92575 508 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 MAML1Q92585 1016 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 PNPLA2Q96AD5 504 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ZNF653Q96CK0 615 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 FCRL4Q96PJ5 515 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 RANBP9Q96S59 729 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 MAP3K3Q99759 626 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TIMM29Q9BSF4 260 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 SPATA16Q9BXB7 569 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 RAB33BQ9H082 229 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 CHST8Q9H2A9 424 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 FGF21Q9NSA1 209 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ASF1BQ9NVP2 202 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 FANCLQ9NW38 375 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 WDR37Q9Y2I8 494 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TTLL3Q9Y4R7 772 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.56□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 POLQO75417 2590 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 CROCCQ5TZA2 2017 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 RGSL1A5PLK6 1076 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 A6NL46 340 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 KMOO15229 486 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TMPRSS2O15393 492 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TMEM63AO94886 807 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 FTLP02792 175 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TPM2P07951 284 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 MMP2P08253 660 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 CD48P09326 243 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 PIRTP0C851 137 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ZNF165P49910 485 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ITGA1P56199 1179 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 RPL26P61254 145 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ACY1Q03154 408 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 RAPSNQ13702 412 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 BECN1Q14457 450 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 GPR19Q15760 415 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 BOLA3Q53S33 107 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 AGAP9Q5VTM2 703 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 CYB5D1Q6P9G0 228 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 WASH2PQ6VEQ5 465 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 C11orf96Q7Z7L8 435 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 RHOT1Q8IXI2 618 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 CCHCR1Q8TD31 782 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 MR1Q95460 341 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 GLYATL1Q969I3 302 aa8.55□□□□□ -1.04
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