RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601358.5

TIMM50-216, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMM50, Length 1,481 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-216ENST00000601358 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 OR4E2Q8NGC2 313 aa20.61■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 HDAC10Q969S8 669 aa20.61■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 MED8Q96G25 268 aa20.61■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 TTC1Q99614 292 aa20.61■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 MAP3K3Q99759 626 aa20.61■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 EFHD1Q9BUP0 239 aa20.61■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 SEMA4CQ9C0C4 833 aa20.61■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 KCNF1Q9H3M0 494 aa20.61■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 AP2A2O94973 939 aa20.6■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 NSG1P42857 185 aa20.6■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 ABHD18Q0P651 414 aa20.6■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 PRKAA1Q13131 559 aa20.6■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 SEMA5AQ13591 1074 aa20.6■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 XKR5Q6UX68 686 aa20.6■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 ZNF605Q86T29 641 aa20.6■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 PPP1R3BQ86XI6 285 aa20.6■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 ESX1Q8N693 406 aa20.6■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 GLIS1Q8NBF1 620 aa20.6■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 OR6P1Q8NGX9 317 aa20.6■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 LCN9Q8WX39 176 aa20.6■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 CD180Q99467 661 aa20.6■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 PDE7BQ9NP56 450 aa20.6■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 PDHA2P29803 388 aa20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 CXCR5P32302 372 aa20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 RPL22P35268 128 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 PREPP48147 710 aa20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 KCNAB1Q14722 419 aa20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 TBR1Q16650 682 aa20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 LINC00303Q3SY05 128 aa20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 TSTD2Q5T7W7 516 aa20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 PHC3Q8NDX5 983 aa20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 ACVR1CQ8NER5 493 aa20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 SLC12A9Q9BXP2 914 aa20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 TLR10Q9BXR5 811 aa20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 SRMSQ9H3Y6 488 aa20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 CASS4Q9NQ75 786 aa20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.59■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 SPTA1P02549 2419 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 TLCD2A6NGC4 264 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 QSOX1O00391 747 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 KIAA0754O94854 1291 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 GOT2P00505 430 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 GSTM1P09488 218 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 ZNF28P17035 718 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 PSMA3P25788 255 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 PRAMEP78395 509 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 GSTM4Q03013 218 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 RPA4Q13156 261 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 TUBB3Q13509 450 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 ITIH4Q14624 930 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 BRD3Q15059 726 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 AFTPHQ6ULP2 937 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 C4orf22Q6V702 233 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 NLRP9Q7RTR0 991 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 GALNT6Q8NCL4 622 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 OR13J1Q8NGT2 312 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 SLC41A2Q96JW4 573 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 RANBP9Q96S59 729 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 OR52A5Q9H2C5 316 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 RARRES3Q9UL19 164 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 PRSS21Q9Y6M0 314 aa20.58■□□□□ 0.89
TIMM50-216ENST00000601358 SPAG6O75602 509 aa20.57■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 DLGAP3O95886 979 aa20.57■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 FTH1P02794 183 aa20.57■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 FGF5P12034 268 aa20.57■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 FOLR1P15328 257 aa20.57■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 FOXN2P32314 431 aa20.57■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 CD151P48509 253 aa20.57■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 HSD11B2P80365 405 aa20.57■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 BASP1P80723 227 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 ACY1Q03154 408 aa20.57■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 KMT5CQ86Y97 462 aa20.57■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 OR4L1Q8NH43 312 aa20.57■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 ELMO1Q92556 727 aa20.57■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 SLC45A3Q96JT2 553 aa20.57■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 SEMA5BQ9P283 1151 aa20.57■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa20.57■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 GSAPA4D1B5 854 aa20.56■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 F8W8V4 182 aa20.56■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 OR56A5P0C7T3 313 aa20.56■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 FAM87AP0C7U9 286 aa20.56■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 CCNYL3P0C7X3 344 aa20.56■□□□□ 0.88
TIMM50-216ENST00000601358 EBLN1P0CF75 366 aa20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms