RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591600.1

APOC4-201, Transcript of apolipoprotein C4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene APOC4, Length 348 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-201ENST00000591600 KRT35Q92764 455 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ULK4Q96C45 1275 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 DCUN1D1Q96GG9 259 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 RMDN2Q96LZ7 410 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 FICDQ9BVA6 458 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 FKBPLQ9UIM3 349 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 POMT2Q9UKY4 750 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 SHANK1Q9Y566 2161 aa14.94□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 CCDC88CQ9P219 2028 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 H7C0C1 242 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 MEN1O00255 615 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 PTPN7P35236 360 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ATP5OP48047 213 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 CD151P48509 253 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 RPS18P62269 152 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 PRKAA1Q13131 559 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 IL10RAQ13651 578 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 PRPSAP1Q14558 356 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 GSE1Q14687 1217 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 GPR33Q49SQ1 333 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 SNX20Q7Z614 316 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 DSELQ8IZU8 1212 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 OR4E2Q8NGC2 313 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ACTL9Q8TC94 416 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 MR1Q95460 341 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 NLNQ9BYT8 704 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 PITPNM3Q9BZ71 974 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ING2Q9H160 280 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 CHST8Q9H2A9 424 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 FANCEQ9HB96 536 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 CRLS1Q9UJA2 301 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa14.93□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 CFAP99D6REC4 459 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 CEACAM4O75871 244 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 POLBP06746 335 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 CDH3P22223 829 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 RORAP35398 523 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 PGDP52209 483 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 KRT33BQ14525 404 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ZNF789Q5FWF6 425 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 DENND5AQ6IQ26 1287 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 DAAM2Q86T65 1068 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 HPS6Q86YV9 775 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 TC2NQ8N9U0 490 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 LCN9Q8WX39 176 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 PPM1MQ96MI6 270 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 COPS8Q99627 209 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 C10orf88Q9H8K7 445 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ACSS2Q9NR19 701 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 SOHLH2Q9NX45 425 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 FER1L5A0AVI2 2057 aa14.92□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 TTLL8A6PVC2 850 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 H7C0S8 307 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 LDB2O43679 373 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 VPS4BO75351 444 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 STK10O94804 968 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 GSTM1P09488 218 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 RBP3P10745 1247 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 ITGALP20701 1170 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 PSMB4P28070 264 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 GSTM4Q03013 218 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 RPA4Q13156 261 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 SPA17Q15506 151 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 CCDC181Q5TID7 509 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 OR13C4Q8NGS5 318 aa14.91□□□□□ -0.02
APOC4-201ENST00000591600 SPATA13Q96N96 652 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms