RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589254.1

USP36-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, human

TSL 3

Gene USP36, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP36-215	ENST00000589254	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	WDR93	Q6P2C0	686 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	IYD	Q6PHW0	289 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	C4orf22	Q6V702	233 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	IFT20	Q8IY31	132 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	TEX26	Q8N6G2	289 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	PAF1	Q8N7H5	531 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	CNTD1	Q8N815	330 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	RSC1A1	Q92681	617 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	INPP5D	Q92835	1189 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	LRRC45	Q96CN5	670 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	TEKT5	Q96M29	485 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	AGAP3	Q96P47	875 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	MGME1	Q9BQP7	344 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	ING2	Q9H160	280 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	WHRN	Q9P202	907 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	SNX24	Q9Y343	169 aa		11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
USP36-215	ENST00000589254	MTOR	P42345	2549 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254		A6NL46	340 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	MASP2	O00187	686 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	NDC80	O14777	642 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	TP73	O15350	636 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	CEACAM4	O75871	244 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	METTL18	O95568	372 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	CP	P00450	1065 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	MYBL2	P10244	700 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	ACP5	P13686	325 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	MCM3	P25205	808 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	FDFT1	P37268	417 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	MAGEA6	P43360	314 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	GPR1	P46091	355 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	RENBP	P51606	427 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	ITGA8	P53708	1063 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	CALCOCO2	Q13137	446 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	KCNJ11	Q14654	390 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	GRM3	Q14832	879 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	MORF4L2	Q15014	288 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	TRADD	Q15628	312 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	TEX44	Q53QW1	395 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	MARC1	Q5VT66	337 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	HOOK3	Q86VS8	718 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	BBS5	Q8N3I7	341 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	BBOF1	Q8ND07	529 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	CPT1B	Q92523	772 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	COX14	Q96I36	57 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	C5orf34	Q96MH7	638 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	GLOD4	Q9HC38	313 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	NT5M	Q9NPB1	228 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	ACSS2	Q9NR19	701 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	RAB21	Q9UL25	225 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	TACC2	O95359	2948 aa		11.14	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	SVIL	O95425	2214 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	PDHA1	P08559	390 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	FGF5	P12034	268 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	FOLR1	P15328	257 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	TPSB2	P20231	275 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	TEAD1	P28347	426 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	ITGA1	P56199	1179 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	MAX	P61244	160 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	DSC2	Q02487	901 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	TPSAB1	Q15661	275 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		11.13	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
USP36-215	ENST00000589254	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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