RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 NOTCH2Q04721 2471 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 F8W8V4 182 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 QSOX1O00391 747 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 WNT9AO14904 365 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 TSPAN6O43657 245 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 DLX3O60479 287 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 NPHS1O60500 1241 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 TSPAN12O95859 305 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 ZNF883P0CG24 379 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 CBSLP0DN79 551 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 GM2AP17900 193 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 NTSR1P30989 418 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 CA5AP35218 305 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 CBSP35520 551 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 GMPRP36959 345 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 HK2P52789 917 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 IL2P60568 153 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 ZBTB16Q05516 673 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 CSHL1Q14406 222 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 GPRC6AQ5T6X5 926 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 SDE2Q6IQ49 451 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 PAQR3Q6TCH7 311 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 DHRS13Q6UX07 377 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 FAM47EQ6ZV65 393 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 Q6ZVL8 140 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 TMPRSS12Q86WS5 348 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 CHPFQ8IZ52 775 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 RGL4Q8IZJ4 473 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 DDHD1Q8NEL9 900 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 OR2T3Q8NH03 318 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 STAG3L4Q8TBR4 150 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 CD200R1Q8TD46 325 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 BTN2A2Q8WVV5 523 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 DTD2Q96FN9 168 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 HSPA12BQ96MM6 686 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 GPR21Q99679 349 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 TRIM55Q9BYV6 548 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 DRC3Q9H069 523 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 FAM107BQ9H098 131 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 ABCG8Q9H221 673 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 RABEP2Q9H5N1 569 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 DYRK4Q9NR20 520 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 TM7SF3Q9NS93 570 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 KCNK4Q9NYG8 393 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 ANKMY1Q9P2S6 941 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 XPR1Q9UBH6 696 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 SCML1Q9UN30 329 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 FADS3Q9Y5Q0 445 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 AK5Q9Y6K8 562 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 FLNCQ14315 2725 aa11.75□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 A8MX80 341 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 KLK8O60259 260 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 DNAJC6O75061 913 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 ADAM23O75077 832 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 NIPSNAP2O75323 286 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 ELFN1P0C7U0 828 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 TPBGLP0DKB5 382 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 GP1BBP13224 206 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 TFEBP19484 476 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 CHRM3P20309 590 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 MAOBP27338 520 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 TEAD1P28347 426 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 TIE1P35590 1138 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 SLC1A6P48664 564 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 LIG3P49916 1009 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 PGGT1BP53609 377 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 CST6Q15828 149 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 ZNF284Q2VY69 593 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 CCDC157Q569K6 752 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 SPDYAQ5MJ70 313 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 EOGTQ5NDL2 527 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 LDLRAP1Q5SW96 308 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 RFLNAQ6ZTI6 216 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 PIM3Q86V86 326 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 CRLF3Q8IUI8 442 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 SPACA3Q8IXA5 215 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 KIRREL3Q8IZU9 778 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 FGF11Q92914 225 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 SCYL1Q96KG9 808 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 CNDP1Q96KN2 507 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 PANX3Q96QZ0 392 aa11.74□□□□□ -0.53
GGA3-217ENST00000583667 ATOH8Q96SQ7 321 aa11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms