RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCG4Q9H172 646 aa32.37■■■□□ 2.77
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC40A1Q9NP59 571 aa32.37■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMYD2Q9NRG4 433 aa32.37■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 LATS2Q9NRM7 1088 aa32.37■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZW10O43264 779 aa32.36■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHRS13Q6UX07 377 aa32.36■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPRED1Q7Z699 444 aa32.36■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDZD3Q86UT5 571 aa32.36■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC38A3Q99624 504 aa32.36■■■□□ 2.77
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NINJ2Q9NZG7 142 aa32.36■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDYLQ9Y232 598 aa32.36■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSAT1Q9Y617 370 aa32.36■■■□□ 2.77
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa32.36■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 STRA8Q7Z7C7 330 aa32.36■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC22A15Q8IZD6 547 aa32.36■■■□□ 2.77
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CTDNEP1-209ENST00000574205 UCK1Q9HA47 277 aa32.36■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 MED16Q9Y2X0 877 aa32.36■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa32.36■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 CACNA1AO00555 2505 aa32.36■■■□□ 2.77
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLCO2B1O94956 709 aa32.35■■■□□ 2.77
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FBF1Q8TES7 1133 aa32.35■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM136AQ96C01 138 aa32.35■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 UNC13CQ8NB66 2214 aa32.34■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALDH4A1P30038 563 aa32.34■■■□□ 2.77
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDNQ99608 321 aa32.34■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHL42Q9P2K6 505 aa32.34■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIAS1O75925 651 aa32.33■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLCN7P51798 805 aa32.33■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa32.33■■■□□ 2.77
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CTDNEP1-209ENST00000574205 VRK3Q8IV63 474 aa32.33■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNK4Q9NYG8 393 aa32.33■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa32.33■■■□□ 2.77
CTDNEP1-209ENST00000574205 LILRA5A6NI73 299 aa32.32■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 VPS26AO75436 327 aa32.32■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACADLP28330 430 aa32.32■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFS1P28331 727 aa32.32■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABCG1P45844 678 aa32.32■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZBTB2Q8N680 514 aa32.32■■■□□ 2.76
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 B4GAT1O43505 415 aa32.31■■■□□ 2.76
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CTDNEP1-209ENST00000574205 EPHA4P54764 986 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR1D5P58170 312 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCL7P80098 99 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPLD1P80108 840 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR18Q14330 331 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 GBX1Q14549 363 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTAGE3PQ8IX95 158 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP32.31■■■□□ 2.763e-10■■■■■ 88.3
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CPNE1Q99829 537 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRN3Q9H3W5 708 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAS2R13Q9NYV9 303 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHRS7Q9Y394 339 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PQM1 296 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAB1Q13506 487 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTLL9Q3SXZ7 439 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 UGT3A1Q6NUS8 523 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPATCH11Q8N954 259 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 MCMBPQ9BTE3 642 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 RHOJQ9H4E5 214 aa32.31■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa32.3■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCEA3O75764 348 aa32.3■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACSL3O95573 720 aa32.3■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM153BP0C7A2 387 aa32.3■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYBL2P10244 700 aa32.3■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD9P21926 228 aa32.3■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP5DP30049 168 aa32.3■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT33BQ14525 404 aa32.3■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM153CQ494X1 144 aa32.3■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM45BPQ6NSW5 357 aa32.3■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
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