RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572905.1

TOM1L1-215, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 3

Gene TOM1L1, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-215	ENST00000572905	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	GPR137B	O60478	399 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	PMS2P2	O95744	297 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	FCGR1A	P12314	374 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	LIMK1	P53667	647 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	MLLT10	P55197	1068 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	ACSM1	Q08AH1	577 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	RDM1	Q8NG50	284 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	CDCA5	Q96FF9	252 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	SFXN2	Q96NB2	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	MIOS	Q9NXC5	875 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	POMT1	Q9Y6A1	747 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-215	ENST00000572905	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	CAMTA2	O94983	1202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	OR52Z1	P0C646	297 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	DAO	P14920	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	KRT2	P35908	639 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	BMX	P51813	675 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	TUBA1B	P68363	451 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	PRKCZ	Q05513	592 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	TROAP	Q12815	778 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	DLG1	Q12959	904 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	GTF2H2	Q13888	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	KLC3	Q6P597	504 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	FIG4	Q92562	907 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	EXT2	Q93063	718 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	SPSB1	Q96BD6	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905		A0A087WV48	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905		A0A0G2JPF8	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	CLDN4	O14493	209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	MEIS2	O14770	477 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	WDR1	O75083	606 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	VDR	P11473	427 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	ZNF12	P17014	697 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	ZNF23	P17027	643 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	ATP5D	P30049	168 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	HOXC13	P31276	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	ASCL1	P50553	236 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	ISL1	P61371	349 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	GLRX5	Q86SX6	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	TMEM219	Q86XT9	240 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	KMT5C	Q86Y97	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-215	ENST00000572905	ERO1A	Q96HE7	468 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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