RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538258.1

PGA3-204, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PGA3, Length 867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-204ENST00000538258 WHRNQ9P202 907 aa8.88□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 GNPTGQ9UJJ9 305 aa8.88□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 RAB21Q9UL25 225 aa8.88□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa8.88□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa8.88□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 MRFAP1Q9Y605 127 aa8.88□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 FAM169AQ9Y6X4 670 aa8.88□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 IGF2RP11717 2491 aa8.88□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 ACACAQ13085 2346 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 DUX1O43812 170 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 ERLIN1O75477 346 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 SASH3O75995 380 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 TTC4O95801 387 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 ELK3P41970 407 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 PREPP48147 710 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 PDX1P52945 283 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 EPHA4P54764 986 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 RPA4Q13156 261 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 GPR18Q14330 331 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 KRT33BQ14525 404 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 CRYMQ14894 314 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 TMED2Q15363 201 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 TYSND1Q2T9J0 566 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 SPANXN3Q5MJ09 141 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 PHF19Q5T6S3 580 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 DUPD1Q68J44 220 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 ZNF470Q6ECI4 717 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 C8orf74Q6P047 294 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 XKR5Q6UX68 686 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 NAPRTQ6XQN6 538 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 LRRC6Q86X45 466 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 CILP2Q8IUL8 1156 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 IGDCC3Q8IVU1 814 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 CALML6Q8TD86 181 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 NCSTNQ92542 709 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 LPGAT1Q92604 370 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 GRAMD1AQ96CP6 724 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 LRRC39Q96DD0 335 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 NXPE2Q96DL1 559 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 CFAP36Q96G28 342 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 DPYSL5Q9BPU6 564 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 FAM167BQ9BTA0 163 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 CARD6Q9BX69 1037 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 STRADBQ9C0K7 418 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 P2RY12Q9H244 342 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 OR52A5Q9H2C5 316 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 ACBD3Q9H3P7 528 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 EPB41L1Q9H4G0 881 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 CHMP2BQ9UQN3 213 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 AK5Q9Y6K8 562 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 AKAP13Q12802 2813 aa8.87□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 CCDC187A0A096LP49 1063 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 CTAGE15A4D2H0 777 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 IQCF5A8MTL0 148 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 H3BMM5 538 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 AGRPO00253 132 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 TP73O15350 636 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 UBXN7O94888 489 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 APOA4P06727 396 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 CTAGE8P0CG41 777 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 TYRP1P17643 537 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 AMD1P17707 334 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 NDUFS1P28331 727 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 PDHA2P29803 388 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 FMO4P31512 558 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 CCKBRP32239 447 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 CCR7P32248 378 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 CSF2RBP32927 897 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 CD151P48509 253 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 SLC7A5Q01650 507 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 CTBP1Q13363 440 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 SQSTM1Q13501 440 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 PLCL1Q15111 1095 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa8.86□□□□□ -0.99
PGA3-204ENST00000538258 C3orf38Q5JPI3 329 aa8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.7 ms