RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-209ENST00000532457 KIAA0895LQ68EN5 471 aa21.51■■□□□ 1.03
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PACSIN3-209ENST00000532457 CFAP206Q8IYR0 622 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-209ENST00000532457 CCNYL1Q8N7R7 359 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-209ENST00000532457 CADM4Q8NFZ8 388 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-209ENST00000532457 BIRC7Q96CA5 298 aa21.51■■□□□ 1.03
PACSIN3-209ENST00000532457 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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PACSIN3-209ENST00000532457 KLK8O60259 260 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-209ENST00000532457 SUPT3HO75486 399 aa21.5■■□□□ 1.03
PACSIN3-209ENST00000532457 FSBPO95073 299 aa21.5■■□□□ 1.03
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PACSIN3-209ENST00000532457 IMPDH1P20839 514 aa21.5■■□□□ 1.03
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PACSIN3-209ENST00000532457 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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PACSIN3-209ENST00000532457 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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PACSIN3-209ENST00000532457 HRO43593 1189 aa21.5■■□□□ 1.03
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PACSIN3-209ENST00000532457 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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PACSIN3-209ENST00000532457 ASB1Q9Y576 335 aa21.5■■□□□ 1.03
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PACSIN3-209ENST00000532457 PNPOQ9NVS9 261 aa21.49■■□□□ 1.03
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PACSIN3-209ENST00000532457 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa21.49■■□□□ 1.03
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PACSIN3-209ENST00000532457 MATN4O95460 622 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-209ENST00000532457 GFAPP14136 432 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-209ENST00000532457 PFN3P60673 137 aa21.48■■□□□ 1.03
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PACSIN3-209ENST00000532457 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC22A9Q8IVM8 553 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-209ENST00000532457 FBXO39Q8N4B4 442 aa21.48■■□□□ 1.03
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PACSIN3-209ENST00000532457 PRSS33Q8NF86 280 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-209ENST00000532457 RFWD2Q8NHY2 731 aa21.48■■□□□ 1.03
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PACSIN3-209ENST00000532457 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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PACSIN3-209ENST00000532457 PDE10AQ9Y233 779 aa21.48■■□□□ 1.03
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PACSIN3-209ENST00000532457 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-209ENST00000532457 CCDC189A1A4V9 331 aa21.48■■□□□ 1.03
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PACSIN3-209ENST00000532457 LRRTM4Q86VH4 590 aa21.48■■□□□ 1.03
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PACSIN3-209ENST00000532457 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM159Q96B96 161 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-209ENST00000532457 SEC16BQ96JE7 1060 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-209ENST00000532457 GSTO2Q9H4Y5 243 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-209ENST00000532457 CAAP1Q9H8G2 361 aa21.48■■□□□ 1.03
PACSIN3-209ENST00000532457 CD274Q9NZQ7 290 aa21.48■■□□□ 1.03
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