RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522519.5

MSC-AS1-208, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 1,537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-208ENST00000522519 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 CCNFP41002 786 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 DAB2P98082 770 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 SLC18A2Q05940 514 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 OGFOD3Q6PK18 319 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 CILP2Q8IUL8 1156 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 LMNTD2Q8IXW0 634 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 NAGSQ8N159 534 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 GPR156Q8NFN8 814 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 CALML6Q8TD86 181 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 GLMNQ92990 594 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 EPN3Q9H201 632 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 SLC17A6Q9P2U8 582 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 GULP1Q9UBP9 304 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 TBC1D29Q9UFV1 150 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 MGAT4DA6NG13 374 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 QSOX1O00391 747 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 EML2O95834 649 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 MYF5P13349 255 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 CKMT2P17540 419 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 ACP1P24666 158 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 PMLP29590 882 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 GP5P40197 560 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 DNAJC3Q13217 504 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 NFE2L1Q14494 772 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 XKR5Q6UX68 686 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 SH2D5Q6ZV89 423 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 ANKRD42Q8N9B4 389 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 BANPQ8N9N5 519 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 OR2L2Q8NH16 312 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 DENND1AQ8TEH3 1009 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 PATE1Q8WXA2 126 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 LPGAT1Q92604 370 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 APOPT1Q96IL0 206 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 TCF12Q99081 682 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 CPNE1Q99829 537 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 FAM167BQ9BTA0 163 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 P2RY12Q9H244 342 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 TOR4AQ9NXH8 423 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 PSAT1Q9Y617 370 aa15.38■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 HMX2A2RU54 273 aa15.37■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 NDUFS3O75489 264 aa15.37■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 F3P13726 295 aa15.37■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 SLC1A2P43004 574 aa15.37■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 ACADVLP49748 655 aa15.37■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 BMPR2Q13873 1038 aa15.37■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 NR0B2Q15466 257 aa15.37■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 C14orf28Q4W4Y0 310 aa15.37■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa15.37■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 TIFABQ6ZNK6 161 aa15.37■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 DENND6AQ8IWF6 608 aa15.37■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 HM13Q8TCT9 377 aa15.37■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 MGARPQ8TDB4 240 aa15.37■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 EVA1BQ9NVM1 165 aa15.37■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 MKS1Q9NXB0 559 aa15.37■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa15.37■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 PFDN6O15212 129 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 SNX2O60749 519 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 RFPL1O75677 317 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 ZWINTO95229 277 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 FTH1P02794 183 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 GSTM1P09488 218 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 OR56A5P0C7T3 313 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 IDSP22304 550 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 RPIAP49247 311 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 GSTM4Q03013 218 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 CTBP1Q13363 440 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 GRTP1Q5TC63 336 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 GUSBP11Q6P575 273 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 WASH2PQ6VEQ5 465 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 CNTN4Q8IWV2 1026 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 RBBP8Q99708 897 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 CCM2Q9BSQ5 444 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 COG4Q9H9E3 785 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 WASH6PQ9NQA3 447 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 PRDM8Q9NQV8 689 aa15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
MSC-AS1-208ENST00000522519 GNPTGQ9UJJ9 305 aa15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms