RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 PCSK4Q6UW60 755 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM110Q86TL2 294 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 TAC4Q86UU9 113 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 DTX2Q86UW9 622 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 CARNMT1Q8N4J0 409 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 SAP25Q8TEE9 199 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 RFFLQ8WZ73 363 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 OMDQ99983 421 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 ALG8Q9BVK2 526 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 POPDC2Q9HBU9 364 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 SERGEFQ9UGK8 458 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.9□□□□□ -1.3
PDE4D-222ENST00000514552 MGAQ8IWI9 3026 aa6.9□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC151A5D8V7 595 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 F5H5T6 163 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 CAPN9O14815 690 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 HSF2BPO75031 334 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 AFPP02771 609 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ABCB4P21439 1286 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 CCR1P32246 355 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 SLC8A1P32418 973 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 LRMPQ12912 555 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 DAG1Q14118 895 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 KCNJ12Q14500 433 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 INSCQ1MX18 579 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 TTI2Q6NXR4 508 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 TRIM69Q86WT6 500 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 CHSY1Q86X52 802 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 AADATQ8N5Z0 425 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 GANCQ8TET4 914 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 CLEC4CQ8WTT0 213 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 FKBP10Q96AY3 582 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 THAP9Q9H5L6 903 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 PREBQ9HCU5 417 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 RRN3Q9NYV6 651 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 PLXNA2O75051 1894 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM131Q92545 1883 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 TRABD2BA6NFA1 517 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 TTC34A8MYJ7 566 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 E5RJQ4 531 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 TLR4O00206 839 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 PPM1DO15297 605 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 CCP110O43303 1012 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 CLDN11O75508 207 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 RASSF9O75901 435 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 WNT1P04628 370 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 CHRM2P08172 466 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 TYRP1P17643 537 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 DRD3P35462 400 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ABCG1P45844 678 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 PSMD8P48556 350 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ACADVLP49748 655 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 SNX16P57768 344 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 NUCB2P80303 420 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 PDCLQ13371 301 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 SHBQ15464 509 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 C5orf22Q49AR2 442 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 FSCBQ5H9T9 825 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 KAZNQ674X7 775 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 NEK5Q6P3R8 708 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4D-222ENST00000514552 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.88□□□□□ -1.31
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