RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511955.5

TRAPPC11-208, Transcript of trafficking protein particle complex 11, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC11, Length 2,342 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11-208ENST00000511955 EBF2Q9HAK2 575 aa4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 SLC40A1Q9NP59 571 aa4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 SETD4Q9NVD3 440 aa4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 FBXO34Q9NWN3 711 aa4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 SPATA2Q9UM82 520 aa4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 PCDHA12Q9UN75 941 aa4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 GINS2Q9Y248 185 aa4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 CACNG2Q9Y698 323 aa4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 GRIN2DO15399 1336 aa4.96□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 A0A1B0GVG6 124 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 ELOVL7A1L3X0 281 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 C22orf46C9J442 243 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 H7C1Q1 480 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 HRKO00198 91 aa4.95□□□□□ -1.62
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TRAPPC11-208ENST00000511955 SLC16A6O15403 523 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 MITFO75030 526 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 CABYRO75952 493 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 OR6B1O95007 311 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 KRT6BP04259 564 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 STAG3L2P0CL84 134 aa4.95□□□□□ -1.62
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TRAPPC11-208ENST00000511955 DARSP14868 501 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
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TRAPPC11-208ENST00000511955 CYP2F1P24903 491 aa4.95□□□□□ -1.62
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TRAPPC11-208ENST00000511955 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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TRAPPC11-208ENST00000511955 ALDH3B1P43353 468 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 SYKP43405 635 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 KRT6CP48668 564 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 SLC11A2P49281 568 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 ZNF75DP51815 510 aa4.95□□□□□ -1.62
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TRAPPC11-208ENST00000511955 ST8SIA6P61647 398 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 PSMC5P62195 406 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 AMPD2Q01433 879 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 PTP4A2Q12974 167 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 TUBB3Q13509 450 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
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TRAPPC11-208ENST00000511955 SPCS2Q15005 226 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 LRRC14Q15048 493 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 ARHGAP44Q17R89 818 aa4.95□□□□□ -1.62
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TRAPPC11-208ENST00000511955 HKDC1Q2TB90 917 aa4.95□□□□□ -1.62
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TRAPPC11-208ENST00000511955 DCST1Q5T197 706 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 GCNT6Q5T4J0 391 aa4.95□□□□□ -1.62
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TRAPPC11-208ENST00000511955 ADCK2Q7Z695 626 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 SCUBE3Q8IX30 993 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 CFAP206Q8IYR0 622 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 BATF2Q8N1L9 274 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 LEMD2Q8NC56 503 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 TMIEQ8NEW7 156 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 EXD1Q8NHP7 514 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
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TRAPPC11-208ENST00000511955 RAD51AP1Q96B01 352 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 PLPPR2Q96GM1 343 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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TRAPPC11-208ENST00000511955 C16orf70Q9BSU1 422 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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TRAPPC11-208ENST00000511955 PRDM12Q9H4Q4 367 aa4.95□□□□□ -1.62
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TRAPPC11-208ENST00000511955 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
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TRAPPC11-208ENST00000511955 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 THEGQ9P2T0 379 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 SARDHQ9UL12 918 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 CLIC4Q9Y696 253 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 A0A087WZY1 265 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 CCDC162PA2VCL2 907 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 TRPC5OSA6NMA1 111 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 USP27XA6NNY8 438 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 GFRA2O00451 464 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 TSPAN4O14817 238 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 KCNAB3O43448 404 aa4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC11-208ENST00000511955 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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