RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 OSBPL8Q9BZF1 889 aa18.77■□□□□ 0.6
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SH3BP2-220ENST00000511663 SRMSQ9H3Y6 488 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP2-220ENST00000511663 SYTL2Q9HCH5 934 aa18.77■□□□□ 0.6
SH3BP2-220ENST00000511663 ACSS2Q9NR19 701 aa18.77■□□□□ 0.6
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SH3BP2-220ENST00000511663 SPATA13Q96N96 652 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2-220ENST00000511663 ALS2CR12Q96Q35 445 aa18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC25A23Q9BV35 468 aa18.75■□□□□ 0.59
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SH3BP2-220ENST00000511663 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa18.74■□□□□ 0.59
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SH3BP2-220ENST00000511663 PTPN7P35236 360 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-220ENST00000511663 CD151P48509 253 aa18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2-220ENST00000511663 OLIG2Q13516 323 aa18.73■□□□□ 0.59
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SH3BP2-220ENST00000511663 POMT2Q9UKY4 750 aa18.73■□□□□ 0.59
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SH3BP2-220ENST00000511663 CYSRT1A8MQ03 144 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-220ENST00000511663 MEN1O00255 615 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-220ENST00000511663 SGTAO43765 313 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB40ALP0C0E4 278 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-220ENST00000511663 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-220ENST00000511663 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-220ENST00000511663 RPA4Q13156 261 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-220ENST00000511663 GPS2Q13227 327 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-220ENST00000511663 PARP6Q2NL67 630 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-220ENST00000511663 TMTC1Q8IUR5 882 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-220ENST00000511663 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-220ENST00000511663 TTC13Q8NBP0 860 aa18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM118BQ9BPY3 351 aa18.72■□□□□ 0.59
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