RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 GPC4O75487 556 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 CHRM3P20309 590 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 ALDH4A1P30038 563 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 STX2P32856 288 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 FOXC1Q12948 553 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 KRT33BQ14525 404 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 TTLL9Q3SXZ7 439 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 CDCP2Q5VXM1 449 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 UGT3A1Q6NUS8 523 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 XKR5Q6UX68 686 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC22A15Q8IZD6 547 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 MVB12BQ9H7P6 319 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 RABGEF1Q9UJ41 708 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 CLCA2Q9UQC9 943 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 DUX1O43812 170 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 KDM1AO60341 852 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 SLCO2B1O94956 709 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 RPN2P04844 631 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 RHOXF2BP0C7M4 288 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 ATP5DP30049 168 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 HSPA14Q0VDF9 509 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 HES3Q5TGS1 186 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 RMDN2Q96LZ7 410 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 RHOXF2Q9BQY4 288 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 UNC13CQ8NB66 2214 aa26.2■■□□□ 1.79
SH3BP2-212ENST00000508338 IQCF5A8MTL0 148 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 HAUS5O94927 633 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 CPNE6O95741 557 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 MT-CO3P00414 261 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 JUPP14923 745 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 ITGB6P18564 788 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 SSTR1P30872 391 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 PHBP35232 272 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 PREPP48147 710 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 CCL7P80098 99 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 MPP1Q00013 466 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 SLMAPQ14BN4 828 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF789Q5FWF6 425 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 KLHL35Q6PF15 583 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 KRT222Q8N1A0 295 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 C9orf72Q96LT7 481 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 TXNDC16Q9P2K2 825 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 KNTC1P50748 2209 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM221BA6H8Z2 402 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 VPS26AO75436 327 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 AHSGP02765 367 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 CD9P21926 228 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 PDHA2P29803 388 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 OR1D5P58170 312 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 NAB1Q13506 487 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 TEX35Q5T0J7 233 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 PIM3Q86V86 326 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 POLG2Q9UHN1 485 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 PTPRBP23467 1997 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 B4GAT1O43505 415 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 NIPSNAP2O75323 286 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 SLU7O95391 586 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 MAPK9P45984 424 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 SHC2P98077 582 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 BRD3Q15059 726 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 CNSTQ6PJW8 725 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 UNC5DQ6UXZ4 953 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 ZBTB2Q8N680 514 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.782e-8■■■■■ 72.2
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SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM74Q96NL1 305 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 TAS2R13Q9NYV9 303 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A1W2PQM1 296 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 D6RAR5 112 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 ACADLP28330 430 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 ECHS1P30084 290 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 GPR18Q14330 331 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 MAP9Q49MG5 647 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 CAPN12Q6ZSI9 719 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 TBC1D21Q8IYX1 336 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-212ENST00000508338 ACVR1CQ8NER5 493 aa26.17■■□□□ 1.78
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