RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	GAMT	Q14353	236 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF460	Q14592	562 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	SNX17	Q15036	470 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	DECR1	Q16698	335 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	KLHL26	Q53HC5	615 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	TEX30	Q5JUR7	227 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	GJB7	Q6PEY0	223 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	NPNT	Q6UXI9	565 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	SERINC5	Q86VE9	423 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	GHDC	Q8N2G8	530 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	NATD1	Q8N6N6	113 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	STKLD1	Q8NE28	680 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	OR52J3	Q8NH60	311 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	NT5C3B	Q969T7	300 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	KTI12	Q96EK9	354 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	MVB12A	Q96EY5	273 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	LURAP1	Q96LR2	239 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	OR1F2P	Q96R84	312 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	SSX3	Q99909	188 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	ITPA	Q9BY32	194 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC22A4	Q9H015	551 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	RAB33B	Q9H082	229 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		6.68	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	ANK1	P16157	1881 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A0J9YYE9	177 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1W2PN81	502 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	FUOM	A2VDF0	154 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF716	A6NP11	495 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971		M0QZ92	97 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	DLL1	O00548	723 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	GPR171	O14626	319 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	MAP2K7	O14733	419 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	SYN3	O14994	580 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	KRT75	O95678	551 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	PGK1	P00558	417 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	LDLR	P01130	860 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	CALCA	P01258	141 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	TRBC1	P01850	177 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	KRT16	P08779	473 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF735	P0CB33	412 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	STAG3L1	P0CL83	205 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	THRB	P10828	461 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	MYF5	P13349	255 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	FOSL2	P15408	326 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	HOXA9	P31269	272 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC5A2	P31639	672 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	CHRNA7	P36544	502 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC11A1	P49279	550 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	GNG11	P61952	73 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	GPLD1	P80108	840 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		6.67	□□□□□ -1.34
FBXO38-208	ENST00000504971	MYO1E	Q12965	1108 aa		6.67	□□□□□ -1.34

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms