RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503668.1

HULC-201, hepatocellular carcinoma up-regulated long non-coding RNA, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HULC, Length 556 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HULC-201ENST00000503668 GRB7Q14451 532 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 OR4D1Q15615 310 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 DGUOKQ16854 277 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 C5orf22Q49AR2 442 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 TIGD5Q53EQ6 642 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ZNF789Q5FWF6 425 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 CDKL4Q5MAI5 379 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 C6orf136Q5SQH8 315 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 C6orf141Q5SZD1 244 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ATG9BQ674R7 924 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 OVOS1Q6IE37 1185 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ZNF549Q6P9A3 640 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 TUBA3EQ6PEY2 450 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 GPR142Q7Z601 462 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 EID3Q8N140 333 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 PARP8Q8N3A8 854 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 OR5K1Q8NHB7 308 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 TMEM40Q8WWA1 233 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 MUL1Q969V5 352 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 CDCA5Q96FF9 252 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 TBATAQ96M53 351 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 GLT1D1Q96MS3 346 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 RNF145Q96MT1 663 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 CGREF1Q99674 301 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 RTP3Q9BQQ7 232 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 HGH1Q9BTY7 390 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 MAGEH1Q9H213 219 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 TUBB1Q9H4B7 451 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ACSS2Q9NR19 701 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 SMPD4Q9NXE4 827 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 FRRS1LQ9P0K9 344 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 PCTPQ9UKL6 214 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 PDE10AQ9Y233 779 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 TMED5Q9Y3A6 229 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 TPRKBQ9Y3C4 175 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 SNX10Q9Y5X0 201 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 A3GALT2U3KPV4 340 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 MYLKQ15746 1914 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.24□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 FAM92AA1XBS5 289 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ISPDA4D126 451 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ARL5CA6NH57 179 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 G3V2T6 193 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 H7C0S8 307 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 SLC28A1O00337 649 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 DPM1O60762 260 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ATP6V1G1O75348 118 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ECI2O75521 394 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 SNAP29O95721 258 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 OTCP00480 354 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ESR1P03372 595 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 IL6P05231 212 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 LINC00032P0C843 101 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ITGAMP11215 1152 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 PKMP14618 531 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 OXTRP30559 389 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 RXRGP48443 463 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 PIK3CGP48736 1102 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 CLCNKBP51801 687 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 CDH13P55290 713 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 IL2P60568 153 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 SMARCB1Q12824 385 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 TRAF2Q12933 501 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ZNF235Q14590 738 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 NR1D2Q14995 579 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 PCSK7Q16549 785 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 TRIM16LQ309B1 348 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 FGD3Q5JSP0 725 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 DLEU7Q6UYE1 221 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 TMEM26Q6ZUK4 368 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 NECAB2Q7Z6G3 386 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 SCD5Q86SK9 330 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 C14orf80Q86SX3 495 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 GPSM1Q86YR5 675 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 LACC1Q8IV20 430 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 KIAA2013Q8IYS2 634 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 SPARTQ8N0X7 666 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 CLEC4FQ8N1N0 589 aa9.23□□□□□ -0.93
HULC-201ENST00000503668 DTWD1Q8N5C7 304 aa9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms