RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496569.1

HDLBP-246, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene HDLBP, Length 374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-246ENST00000496569 IQCF5A8MTL0 148 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 ANKRD34CP0C6C1 535 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 EBLN1P0CF75 366 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 FOLR1P15328 257 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 PSMA3P25788 255 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 MGAT1P26572 445 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 CD82P27701 267 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 NMBRP28336 390 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 RAB15P59190 212 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 PRKG2Q13237 762 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 SKIDA1Q1XH10 827 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 ANKRD22Q5VYY1 191 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 AFTPHQ6ULP2 937 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 CEACAM20Q6UY09 585 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 PRSS42Q7Z5A4 293 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 OR4E2Q8NGC2 313 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 OR6P1Q8NGX9 317 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 FERD3LQ96RJ6 166 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 SPRY4Q9C004 299 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 KLHL25Q9H0H3 589 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 CHRAC1Q9NRG0 131 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 HRASLS2Q9NWW9 162 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 SYBUQ9NX95 663 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 CIDEBQ9UHD4 219 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 IL17BQ9UHF5 180 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 ACSL5Q9ULC5 683 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 PLAGL1Q9UM63 463 aa11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
HDLBP-246ENST00000496569 SPTA1P02549 2419 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 USP27XA6NNY8 438 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 ERVH48-1M5A8F1 160 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 KIAA0754O94854 1291 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 DLGAP3O95886 979 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 ADRA1DP25100 572 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 ATP1A2P50993 1020 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 RHDQ02161 417 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 ACVR1Q04771 509 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 KRT33BQ14525 404 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 KRT222Q8N1A0 295 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 MPP5Q8N3R9 675 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 OR52E1Q8NGJ3 308 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 OR5AR1Q8NGP9 310 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 COG1Q8WTW3 980 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 KLHL6Q8WZ60 621 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 ELMO1Q92556 727 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 ZDHHC12Q96GR4 267 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 RANBP9Q96S59 729 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 FBXO8Q9NRD0 319 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 EPHA6Q9UF33 1036 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 MED13Q9UHV7 2174 aa11.89□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 PCM1Q15154 2024 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 GOLGA8KD6RF30 607 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 GOLGA8TH3BQL2 631 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 BTN3A3O00478 584 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 BTN3A1O00481 513 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF185O15231 689 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 NRDCO43847 1150 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 AVILO75366 819 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 TMEM63AO94886 807 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 GAS8O95995 478 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 PRKAR1AP10644 381 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 PVRP15151 417 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 NELFEP18615 380 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 F8A1P23610 371 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 PRAMEP78395 509 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 ITIH4Q14624 930 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 GPR19Q15760 415 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 LINC00303Q3SY05 128 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 PACS1Q6VY07 963 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 TRIM73Q86UV7 250 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 OOSP2Q86WS3 158 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 RASGRP3Q8IV61 690 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 VRK3Q8IV63 474 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 NLGN4XQ8N0W4 816 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 EXD3Q8N9H8 876 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 GALNT6Q8NCL4 622 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 OR4L1Q8NH43 312 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 HEXDCQ8WVB3 486 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 MFSD3Q96ES6 412 aa11.88□□□□□ -0.51
HDLBP-246ENST00000496569 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms