RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494672.1

CCDC66-222, Transcript of coiled-coil domain containing 66, human

TSL 4

Gene CCDC66, Length 577 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC66-222	ENST00000494672	PPP3CC	P48454	512 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	AMT	P48728	403 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	PDLIM4	P50479	330 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CARD18	P57730	90 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	RAB14	P61106	215 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	DCAF7	P61962	342 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	HTD2	P86397	168 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	PRKCE	Q02156	737 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	POU3F1	Q03052	451 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CDK18	Q07002	472 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	LGALS3BP	Q08380	585 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	TFCP2	Q12800	502 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	DNAJC3	Q13217	504 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	DMC1	Q14565	340 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	AANAT	Q16613	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	UGP2	Q16851	508 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	TTC23L	Q6PF05	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CDH26	Q8IXH8	852 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CEP112	Q8N8E3	955 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	EID2B	Q96D98	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	SGF29	Q96ES7	293 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CDRT15	Q96T59	188 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	RTKN	Q9BST9	563 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	GBA3	Q9H227	469 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	NEK6	Q9HC98	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	PREB	Q9HCU5	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672		Q9N2J8	555 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	EURL	Q9NYK6	297 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	NPAT	Q14207	1427 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	NACAD	O15069	1562 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672		E7EVH7	732 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	GRM8	O00222	908 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	HSPB6	O14558	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CCNDBP1	O95273	360 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	IFNA14	P01570	189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	UROD	P06132	367 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	GLA	P06280	429 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	POLB	P06746	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ASNS	P08243	561 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ITGA2B	P08514	1039 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	KRT7	P08729	469 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CLTA	P09496	248 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CLTB	P09497	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	FCGR2A	P12318	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ATP1A3	P13637	1013 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ANPEP	P15144	967 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CRABP2	P29373	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	BMI1	P35226	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	PPM1A	P35813	382 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	LIFR	P42702	1097 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	POU3F4	P49335	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CLCN5	P51795	746 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	NUDT6	P53370	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	CDH12	P55289	794 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ACTR1A	P61163	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ENPEP	Q07075	957 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	NR1D2	Q14995	579 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ALX1	Q15699	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	TAF12	Q16514	161 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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