RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	KDM1B	Q8NB78	822 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CCNY	Q8ND76	341 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	IFI44	Q8TCB0	444 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM3C	Q92520	227 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	KIRREL1	Q96J84	757 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	VPS45	Q9NRW7	570 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	FETUB	Q9UGM5	382 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	GGA2	Q9UJY4	613 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	VWA7	Q9Y334	891 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		5.7	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	NUMA1	Q14980	2115 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TSPAN11	A1L157	253 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	HRK	O00198	91 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MSTN	O14793	375 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TULP3	O75386	442 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	GJB3	O75712	270 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM155B	O75949	473 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TMCC1	O94876	653 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	WNT11	O96014	354 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	EPO	P01588	193 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	C8B	P07358	591 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SP9	P0CG40	484 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	GAA	P10253	952 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SRC	P12931	536 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TDGF1	P13385	188 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ARSA	P15289	507 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	DDC	P20711	480 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	KCNJ5	P48544	419 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	HSPA7	P48741	367 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CSRP3	P50461	194 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ACVR1	Q04771	509 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC20A2	Q08357	652 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CDH18	Q13634	790 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PMS2P11	Q13670	270 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	RUNX3	Q13761	415 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PDGFRL	Q15198	375 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	GEN1	Q17RS7	908 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PHF19	Q5T6S3	580 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MARC1	Q5VT66	337 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM135	Q86UB9	458 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	YAF2	Q8IY57	180 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MPP5	Q8N3R9	675 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	IFT81	Q8WYA0	676 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ATP2A3	Q93084	1043 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	AGAP3	Q96P47	875 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ZIM3	Q96PE6	472 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	RANBP9	Q96S59	729 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	BBS2	Q9BXC9	721 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	ECT2	Q9H8V3	914 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	CD248	Q9HCU0	757 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		5.69	□□□□□ -1.5
DCTN1-222	ENST00000492717	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5

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