RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-208ENST00000487290 NDUFS1P28331 727 aa16.19■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 CARSP49589 748 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
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HCLS1-208ENST00000487290 PDX1P52945 283 aa16.19■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 TUBB4BP68371 445 aa16.19■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 DHRS13Q6UX07 377 aa16.19■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 TMEM26Q6ZUK4 368 aa16.19■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 IFT20Q8IY31 132 aa16.19■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 GALNT15Q8N3T1 639 aa16.19■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 GRAMD1AQ96CP6 724 aa16.19■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 RHPN2P1A8MT19 583 aa16.18■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 IQCF5A8MTL0 148 aa16.18■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 D6RAR5 112 aa16.18■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 B4GAT1O43505 415 aa16.18■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 HAUS5O94927 633 aa16.18■□□□□ 0.18
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HCLS1-208ENST00000487290 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.18
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HCLS1-208ENST00000487290 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
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HCLS1-208ENST00000487290 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 TMEM159Q96B96 161 aa16.18■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 C9orf72Q96LT7 481 aa16.18■□□□□ 0.18
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HCLS1-208ENST00000487290 SMYD2Q9NRG4 433 aa16.18■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 ZFATQ9P243 1243 aa16.18■□□□□ 0.18
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HCLS1-208ENST00000487290 CRYL1Q9Y2S2 319 aa16.18■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 FREM2Q5SZK8 3169 aa16.17■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 NIPSNAP2O75323 286 aa16.17■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 VIPP01282 170 aa16.17■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 APOA4P06727 396 aa16.17■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 FMO4P31512 558 aa16.17■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 STX2P32856 288 aa16.17■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
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HCLS1-208ENST00000487290 CNSTQ6PJW8 725 aa16.17■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 NEK10Q6ZWH5 1172 aa16.17■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 RASGRP3Q8IV61 690 aa16.17■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 PALM2Q8IXS6 379 aa16.17■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 KRT222Q8N1A0 295 aa16.17■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 GIMAP7Q8NHV1 300 aa16.17■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP16.17■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 CXorf40BQ96DE9 158 aa16.17■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 C12orf66Q96MD2 445 aa16.17■□□□□ 0.18
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HCLS1-208ENST00000487290 SLC17A6Q9P2U8 582 aa16.17■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 PSMD13Q9UNM6 376 aa16.17■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa16.17■□□□□ 0.18
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HCLS1-208ENST00000487290 FRYQ5TBA9 3013 aa16.16■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 CD1CP29017 333 aa16.16■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 CCKBRP32239 447 aa16.16■□□□□ 0.18
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HCLS1-208ENST00000487290 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
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HCLS1-208ENST00000487290 SYTL3Q4VX76 610 aa16.16■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 UNC5DQ6UXZ4 953 aa16.16■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
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HCLS1-208ENST00000487290 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
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HCLS1-208ENST00000487290 SLITRK4Q8IW52 837 aa16.16■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 TRIM48Q8IWZ4 208 aa16.16■□□□□ 0.18
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HCLS1-208ENST00000487290 CD200R1Q8TD46 325 aa16.16■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 SLC38A3Q99624 504 aa16.16■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 TXLNGYQ9BZA5 131 aa16.16■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 CCDC68Q9H2F9 335 aa16.16■□□□□ 0.18
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HCLS1-208ENST00000487290 SLC24A2Q9UI40 661 aa16.16■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 DHRS7Q9Y394 339 aa16.16■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa16.16■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 KIF26BQ2KJY2 2108 aa16.15■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 CASC3O15234 703 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 DUX1O43812 170 aa16.15■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 SLU7O95391 586 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 MATN4O95460 622 aa16.15■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 CPNE6O95741 557 aa16.15■□□□□ 0.18
HCLS1-208ENST00000487290 MT-CO3P00414 261 aa16.15■□□□□ 0.18
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