RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 SP140Q13342 867 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF542PQ5EBM4 170 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 CTSL3PQ5NE16 218 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 LAYNQ6UX15 382 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 TIFABQ6ZNK6 161 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 PDZD3Q86UT5 571 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 TBC1D21Q8IYX1 336 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 SLC22A15Q8IZD6 547 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 IQCKQ8N0W5 287 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 KRT222Q8N1A0 295 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 STAG3L4Q8TBR4 150 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ATL1Q8WXF7 558 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 RAD51AP1Q96B01 352 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 LINGO1Q96FE5 620 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 PGM2Q96G03 612 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ZIM3Q96PE6 472 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 CDC6Q99741 560 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 LRRC61Q9BV99 259 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 EPB41L1Q9H4G0 881 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 SLC32A1Q9H598 525 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 PLAC1Q9HBJ0 212 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 SMYD2Q9NRG4 433 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 SNX15Q9NRS6 342 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 POT1Q9NUX5 634 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 GRID1Q9ULK0 1009 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ASF1AQ9Y294 204 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 PRKAB1Q9Y478 270 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 FANCMQ8IYD8 2048 aa9.55□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 SLC5A10A0PJK1 596 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 IQCF5A8MTL0 148 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 B4DGG1 531 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 COPEO14579 308 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 YY2O15391 372 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 FFAR2O15552 330 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 GLRA3O75311 464 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 SHBGP04278 402 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC166P0CW27 439 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 CDK4P11802 303 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 TAC1P20366 129 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 RPL10P27635 214 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 GABRB3P28472 473 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 CLCN7P51798 805 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 TAS2R39P59534 338 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ASPHQ12797 758 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 C1orf61Q13536 156 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 NFE2L1Q14494 772 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.883e-6■□□□□ 10.7
CTPS1-210ENST00000486889 ACAP2Q15057 778 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 PLCL1Q15111 1095 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 NR0B2Q15466 257 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF789Q5FWF6 425 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ARMC6Q6NXE6 501 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 PRR23CQ6ZRP0 262 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF547Q8IVP9 402 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 HOMEZQ8IX15 550 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ARL10Q8N8L6 244 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 CD200R1Q8TD46 325 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 NAT6Q93015 286 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 FAM136AQ96C01 138 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 SCYL1Q96KG9 808 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 C12orf66Q96MD2 445 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 FERD3LQ96RJ6 166 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 DHRS4Q9BTZ2 278 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 DERL2Q9GZP9 239 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ZMYND15Q9H091 742 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 WWP1Q9H0M0 922 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 GULP1Q9UBP9 304 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 LGALS13Q9UHV8 139 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 ACTL7BQ9Y614 415 aa9.54□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 LNP1A1A4G5 178 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 PATE3B3GLJ2 98 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 MATN2O00339 956 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 BTN3A1O00481 513 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 SDC3O75056 442 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 SMIM24O75264 130 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 GPC4O75487 556 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 PIAS1O75925 651 aa9.53□□□□□ -0.88
CTPS1-210ENST00000486889 FAM155BO75949 473 aa9.53□□□□□ -0.88
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