RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486261.5

KRIT1-222, Transcript of KRIT1, ankyrin repeat containing, human

TSL 1 (best)

Gene KRIT1, Length 4,057 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRIT1-222	ENST00000486261	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	XKR8	Q9H6D3	395 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TYRP1	P17643	537 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CDC25B	P30305	580 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TRIM23	P36406	574 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PGM1	P36871	562 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	KCNJ1	P48048	391 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ARHGDIB	P52566	201 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	WNT7B	P56706	349 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ACTR1A	P61163	376 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	IL10RB	Q08334	325 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GAS6	Q14393	721 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	KIF19	Q2TAC6	998 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ARSI	Q5FYB1	569 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261		Q6ZVU0	165 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SEC14L1	Q92503	715 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC77	Q9BR77	488 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261		H7C1Q1	480 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SNPH	O15079	494 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	KDELR3	O43731	214 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CRCP	O75575	148 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	FH	P07954	510 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF30	P17039	623 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	PRKCH	P24723	683 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MAOB	P27338	520 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CD70	P32970	193 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GPR1	P46091	355 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CPA2	P48052	419 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	HCAR3	P49019	387 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	NOMO3	P69849	1222 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MAMLD1	Q13495	774 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	DPYS	Q14117	519 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TREML1	Q86YW5	311 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	HID1	Q8IV36	788 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	GPR156	Q8NFN8	814 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	OR10G6	Q8NH81	332 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	DIO2	Q92813	273 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MCEE	Q96PE7	176 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ABHD1	Q96SE0	405 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TCF12	Q99081	682 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	LHX6	Q9UPM6	363 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	QSOX1	O00391	747 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	AREL1	O15033	823 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	NDST3	O95803	873 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	EDN3	P14138	238 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	MMP8	P22894	467 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KRIT1-222	ENST00000486261	S100A1	P23297	94 aa		4.76	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms