RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467983.1

ABCB4-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 4, human

TSL 3

Gene ABCB4, Length 414 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB4-208	ENST00000467983	RAB26	Q9ULW5	256 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PLLP	Q9Y342	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PSME4	Q14997	1843 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PARP14	Q460N5	1801 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SCN9A	Q15858	1988 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	KBTBD13	C9JR72	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PSMD9	O00233	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	MCF2L	O15068	1137 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CHAD	O15335	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM189A1	O60320	539 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	BBOX1	O75936	387 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	KRT38	O76015	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	OR6B1	O95007	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TNFAIP8	O95379	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PGM3	O95394	542 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	BPGM	P07738	259 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	KRT7	P08729	469 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TCF4	P15884	667 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	MMP8	P22894	467 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ABCD1	P33897	745 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ELK3	P41970	407 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	HSPA13	P48723	471 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SERPINB9	P50453	376 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	STAT2	P52630	851 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PSMC5	P62195	406 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DLG1	Q12959	904 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CUL2	Q13617	745 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DPYSL3	Q14195	570 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	KRT81	Q14533	505 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	KCNJ11	Q14654	390 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PSMD6	Q15008	389 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TAZ	Q16635	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	INSC	Q1MX18	579 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ZACN	Q401N2	412 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	C2CD6	Q53TS8	623 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	XKR9	Q5GH70	373 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	C4orf19	Q8IY42	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	NUP93	Q8N1F7	819 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ACTL9	Q8TC94	416 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CFAP36	Q96G28	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	POLL	Q9UGP5	575 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CDH22	Q9UJ99	828 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	BLOC1S6	Q9UL45	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCB4-208	ENST00000467983	POMP	Q9Y244	141 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms