RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 EGLN1Q9GZT9 426 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 C2CD2Q9Y426 696 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MAP3K5Q99683 1374 aa3.74□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ABCA6Q8N139 1617 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 GOLGA3Q08378 1498 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MIA2Q96PC5 1412 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM8BA6NDV4 472 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ANTXRLA6NF34 631 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 PLOD2O00469 737 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC22A2O15244 555 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MBD4O95243 580 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 GNB3P16520 340 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 GNAZP19086 355 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 CBLP22681 906 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 HOXC8P31273 242 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MAN1A1P33908 653 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 VEGFCP49767 419 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 PRKAA1Q13131 559 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 KRT32Q14532 448 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MVPQ14764 893 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 CCDC6Q16204 474 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 DUOXA1Q1HG43 343 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ASPRV1Q53RT3 343 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ACSM2BQ68CK6 577 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 FAAH2Q6GMR7 532 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 CFAP77Q6ZQR2 320 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 GALNT13Q8IUC8 556 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 UNC5CLQ8IV45 518 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 TRPC4APQ8TEL6 797 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MOAP1Q96BY2 351 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 LRR1Q96L50 414 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 OR2A14Q96R47 310 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 NUDCD1Q96RS6 583 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ITPAQ9BY32 194 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 PLK3Q9H4B4 646 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 RAD21L1Q9H4I0 556 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 PAG1Q9NWQ8 432 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 YIPF1Q9Y548 306 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 RGPD1P0DJD0 1748 aa3.73□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 BRWD3Q6RI45 1802 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MYOM1P52179 1685 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 FRMD3A2A2Y4 597 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 A6NL46 340 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 C15orf62A8K5M9 175 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MYO1GB0I1T2 1018 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 H0YIN7 160 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 EPHA2P29317 976 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 HSD17B4P51659 736 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 THOP1P52888 689 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MAMLD1Q13495 774 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 CRYMQ14894 314 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MEP1AQ16819 746 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 SNX30Q5VWJ9 437 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 KLHL35Q6PF15 583 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 TICAM1Q8IUC6 712 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 CRYBG2Q8N1P7 616 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 WDTC1Q8N5D0 677 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF485Q8NCK3 441 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM190Q8WZ59 177 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MPP4Q96JB8 637 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 DDOQ99489 341 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MUC13Q9H3R2 512 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 SH2D4AQ9H788 454 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 KAT14Q9H8E8 782 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ADPRHL2Q9NX46 363 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ADCY9O60503 1353 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 ADGRB2O60241 1585 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 GLI3P10071 1580 aa3.72□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.81
RABGGTB-206ENST00000467748 MROH1Q8NDA8 1641 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-206ENST00000467748 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A087X002 238 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A087X0M5 115 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A1B0GX30 115 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-206ENST00000467748 MAGEB17A8MXT2 336 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-206ENST00000467748 TMCC2O75069 709 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-206ENST00000467748 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-206ENST00000467748 ACTN1P12814 892 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-206ENST00000467748 CKMT2P17540 419 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-206ENST00000467748 NR2C2P49116 596 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-206ENST00000467748 SETQ01105 290 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-206ENST00000467748 PMP22Q01453 160 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-206ENST00000467748 JADE1Q6IE81 842 aa3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms