RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TTC17Q96AE7 1141 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 GBP5Q96PP8 586 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 OR6C1Q96RD1 312 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TSPAN18Q96SJ8 248 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNK16Q96T55 309 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ELOVL4Q9GZR5 314 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF696Q9H7X3 374 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 OSER1Q9NX31 292 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 B4GALT6Q9UBX8 382 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 RASAL2Q9UJF2 1139 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CHST2Q9Y4C5 530 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TRPM6Q9BX84 2022 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TENM3Q9P273 2699 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 DIRC3C9JPN6 131 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 GABRDO14764 452 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TGFB1I1O43294 461 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 KLK8O60259 260 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SPAG6O75602 509 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TYRP1P17643 537 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CYP11B2P19099 503 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PNPLA4P41247 253 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 NPTX2P47972 431 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 POLD2P49005 469 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PTH2RP49190 550 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ELLP55199 621 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ECT2LQ008S8 904 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 NHLH2Q02577 135 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 DUSP2Q05923 314 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC15Q0P6D6 951 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 FOXI1Q12951 378 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 STRN3Q13033 797 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 NR1D2Q14995 579 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 BEAN1Q3B7T3 259 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ACCSLQ4AC99 568 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 FILIP1LQ4L180 1135 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 C4orf46Q504U0 113 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PIK3R6Q5UE93 754 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ANKRD40Q6AI12 368 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 ENPP7Q6UWV6 458 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 OR1N1Q8NGS0 311 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 KIAA1524Q8TCG1 905 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 AGAP11Q8TF27 550 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 BICD1Q96G01 975 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PKP2Q99959 881 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 TNMDQ9H2S6 317 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNMB3Q9NPA1 279 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 DYRK4Q9NR20 520 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 PDP2Q9P2J9 529 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 DKK2Q9UBU2 259 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 SPO11Q9Y5K1 396 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGGTB-203ENST00000459697 COL7A1Q02388 2944 aa4.59□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 ARHGEF35A5YM69 484 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 IGLON5A6NGN9 336 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 UNC119BA6NIH7 251 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 TBL1XO60907 577 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 LY86O95711 162 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 CD58P19256 250 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 MX1P20591 662 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 OTX2P32243 289 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 NNMTP40261 264 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 EPHB1P54762 984 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 GYS2P54840 703 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 SRP54P61011 504 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 YPEL5P62699 121 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 COG7P83436 770 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 SOWAHAQ2M3V2 549 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 PITRM1Q5JRX3 1037 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 VAX1Q5SQQ9 334 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 ARSKQ6UWY0 536 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 VPS36Q86VN1 386 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 MFN1Q8IWA4 741 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 CD302Q8IX05 232 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM9BQ8IZU0 186 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 CDYL2Q8N8U2 506 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 C3orf20Q8ND61 904 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 CATSPER1Q8NEC5 780 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 MYRIPQ8NFW9 859 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-203ENST00000459697 LILRB4Q8NHJ6 448 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 138.4 ms