RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 RBSNQ9H1K0 784 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 FAM96AQ9H5X1 160 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 SOHLH2Q9NX45 425 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 ANAPC2Q9UJX6 822 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
HERC3-206ENST00000431413 PIPSLA2A3N6 862 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 MKRN2OSH3BPM6 223 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 H7C0S8 307 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 LDB2O43679 373 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 CREG1O75629 220 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 GAS8O95995 478 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 EBLN1P0CF75 366 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 F8A1P23610 371 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 CD151P48509 253 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 RPS15P62841 145 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 DNASE1L3Q13609 305 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 KCNAB1Q14722 419 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 LINC00523Q86TU6 105 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 OR4E2Q8NGC2 313 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 NAT14Q8WUY8 206 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 LCN9Q8WX39 176 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 RNF31Q96EP0 1072 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 RMDN2Q96LZ7 410 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 GPR87Q9BY21 358 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 TWSG1Q9GZX9 223 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 SRMSQ9H3Y6 488 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 FANCEQ9HB96 536 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 KCND1Q9NSA2 647 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 QSOX1O00391 747 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 SGTAO43765 313 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 SCRG1O75711 98 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 NTRK1P04629 796 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 CDH3P22223 829 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 ACRV1P26436 265 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 TLE1Q04724 770 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 CACNG1Q06432 222 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 RPA4Q13156 261 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 LAMB3Q13751 1172 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 KCTD11Q693B1 232 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 CT55Q8WUE5 264 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 STYXQ8WUJ0 223 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 MVB12BQ9H7P6 319 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 COG4Q9H9E3 785 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 SYTL2Q9HCH5 934 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 C1GALT1Q9NS00 363 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 IMPACTQ9P2X3 320 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 BTRCQ9Y297 605 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 KCNMB2Q9Y691 235 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 GSAPA4D1B5 854 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 CDC14CA4D256 554 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 F8W8V4 182 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 CCL22O00626 93 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 AP2A2O94973 939 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 TIAF1O95411 115 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 METTL18O95568 372 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 AP2A1O95782 977 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 FTCDO95954 541 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 TPH1P17752 444 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 CASRP41180 1078 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 POU6F1Q14863 301 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 SLC35B2Q8TB61 432 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 TTC1Q99614 292 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 TMEM121Q9BTD3 319 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 LATS2Q9NRM7 1088 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 POMT2Q9UKY4 750 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 RFPL1O75677 317 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 NSG1P42857 185 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HERC3-206ENST00000431413 GSDMDP57764 484 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms