RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428457.1

TNS3-204, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNS3, Length 5,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-204ENST00000428457 APOLD1Q96LR9 279 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 MUC13Q9H3R2 512 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 GLOD4Q9HC38 313 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 ELOVL2Q9NXB9 296 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 IGSF9Q9P2J2 1179 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 ERN1O75460 977 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 CLPXO76031 633 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 OR5F1O95221 314 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 GNAZP19086 355 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 TTPAP49638 278 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 SLC18A1P54219 525 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 TAS2R39P59534 338 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 RHAGQ02094 409 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 MOGSQ13724 837 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 TLR1Q15399 786 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 ZNF613Q6PF04 617 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 PCDH19Q8TAB3 1148 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 SEC14L1Q92503 715 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 CD320Q9NPF0 282 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 ARL5CA6NH57 179 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 ARHGEF33A8MVX0 844 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 TULP3O75386 442 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 AP2A1O95782 977 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 RLN1P04808 185 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 PGRP06401 933 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 CFHP08603 1231 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 PSKH1P11801 424 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 ECHS1P30084 290 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 CLCQ05315 142 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 DAG1Q14118 895 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 SULT1C3Q6IMI6 304 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 C1orf21Q9H246 121 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 PDZD7Q9H5P4 517 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 EXO5Q9H790 373 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 TBCCD1Q9NVR7 557 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 GMEB2Q9UKD1 530 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 ENTPD4Q9Y227 616 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 C10orf71Q711Q0 1435 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 FAM25EA8MYX2 175 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 TNFRSF11BO00300 401 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 ARPC2O15144 300 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 SLC22A1O15245 554 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 SLC6A2P23975 617 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 SDC2P34741 201 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 CYP20A1Q6UW02 462 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 STRADAQ7RTN6 431 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 TAF8Q7Z7C8 310 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 TRPV1Q8NER1 839 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 CLEC4DQ8WXI8 215 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 PIK3R3Q92569 461 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 DCSTAMPQ9H295 470 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 EHD1Q9H4M9 534 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 IL23AQ9NPF7 189 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 ABI3Q9P2A4 366 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 TESMINQ9Y4I5 508 aa9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 A6NHS1 94 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 K7EPI3 171 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 SPATA31D3P0C874 917 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 NPTX1Q15818 432 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 XKR6Q5GH73 641 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 LIN54Q6MZP7 749 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 MINDY2Q8NBR6 621 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 OR9I1Q8NGQ6 314 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 FAIM2Q9BWQ8 316 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 VPS4AQ9UN37 437 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 CNTN6Q9UQ52 1028 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 A0A0J9YVX5 310 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 FABP12A6NFH5 140 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 I3L521 148 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 EPHX1P07099 455 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 CCL14Q16627 93 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 HKDC1Q2TB90 917 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 SLC25A52Q3SY17 297 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 ZFP28Q8NHY6 868 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 SCLYQ96I15 445 aa9.85□□□□□ -0.83
TNS3-204ENST00000428457 SNX27Q96L92 541 aa9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms