RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MSH3P20585 1137 aa18.36■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CTNNB1P35222 781 aa18.36■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF77Q15935 545 aa18.36■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AP5B1Q2VPB7 878 aa18.36■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RABL3Q5HYI8 236 aa18.36■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM215Q68D42 235 aa18.36■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LCN8Q6JVE9 175 aa18.36■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA2013Q8IYS2 634 aa18.36■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GALNT4Q8N4A0 578 aa18.36■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CANT1Q8WVQ1 401 aa18.36■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARMC5Q96C12 935 aa18.36■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM15Q9C019 465 aa18.36■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACTL8Q9H568 366 aa18.36■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EGFL7Q9UHF1 273 aa18.36■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa18.36■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AQP12BA6NM10 295 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR56A5P0C7T3 313 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BMPR1AP36894 532 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CASP2P42575 452 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HSPA13P48723 471 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CYP20A1Q6UW02 462 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AQP12AQ8IXF9 295 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POF1BQ8WVV4 589 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NTMT1Q9BV86 223 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM192AQ9GZU8 254 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARMC1Q9NVT9 282 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLAMF8Q9P0V8 285 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACTR3BQ9P1U1 418 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D14Q9P2M4 693 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD84Q9UIB8 345 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DYTNA2CJ06 578 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FFAR3O14843 346 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD28O15084 1053 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR42O15529 346 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EPB42P16452 691 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHN2P52757 468 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CREB5Q02930 508 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGEF7Q14155 803 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HMBOX1Q6NT76 420 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BRAT1Q6PJG6 821 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARPINQ7Z6K5 226 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPPL2CQ8IUH8 684 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLPP6Q8IY26 295 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPP3R2Q96LZ3 170 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALG2Q9H553 416 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC24A3Q9HC58 644 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERVW-1Q9UQF0 538 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa18.35■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARPC2O15144 300 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANXA5P08758 320 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AOAHP28039 575 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIK3CGP48736 1102 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GSK3BP49841 420 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NTHL1P78549 312 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MTX3Q5HYI7 312 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF165Q6ZSG1 346 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RTL10Q7L3V2 364 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PKD2L2Q9NZM6 624 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRPS1Q9UHF7 1281 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF11Q9Y3C5 154 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WNT6Q9Y6F9 365 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GRXCR2A6NFK2 248 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TIPRLO75663 272 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STK16O75716 305 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPPAP01160 153 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EBLN1P0CF75 366 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF30P17039 623 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPIAP49247 311 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDKL1Q00532 357 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GBX1Q14549 363 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC2A7Q6PXP3 512 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DET1Q7L5Y6 550 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AMIGO2Q86SJ2 522 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AHI1Q8N157 1196 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPP10Q8N608 796 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NAT16Q8N8M0 369 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM110BQ8TC76 370 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPPL3Q8TCT6 385 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZSWIM3Q96MP5 696 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GBP5Q96PP8 586 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSC22D3Q99576 134 aa18.34■□□□□ 0.53
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAD9AQ99638 391 aa18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms