RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413164.6

SLC13A3-204, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SLC13A3, Length 2,008 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-204ENST00000413164 KATNA1O75449 491 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 PBX2P40425 430 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 LRRC73Q5JTD7 316 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 PRSS36Q5K4E3 855 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 FRS2Q8WU20 508 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 ACTL8Q9H568 366 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 MARK1Q9P0L2 795 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 OPTCQ9UBM4 332 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 ANKRD28O15084 1053 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 TCF3P15923 654 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 MSH3P20585 1137 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 ATP6V1B2P21281 511 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 CDKL4Q5MAI5 379 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 BRAT1Q6PJG6 821 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 ZFAND4Q86XD8 727 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 OR2T34Q8NGX1 318 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 OR2T3Q8NH03 318 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 TMEM125Q96AQ2 219 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 HBEGFQ99075 208 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 NTMT1Q9BV86 223 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 WWOXQ9NZC7 414 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 CCDC154A6NI56 674 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 K7EPI3 171 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 AOAHP28039 575 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 BNIP2Q12982 314 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 LEMD2Q8NC56 503 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 MYLIPQ8WY64 445 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 MRGPRX3Q96LB0 322 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 ABCG8Q9H221 673 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 SMOXQ9NWM0 555 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 RAB26Q9ULW5 256 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 DYTNA2CJ06 578 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 GRXCR2A6NFK2 248 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 ZNF30P17039 623 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 HMOX2P30519 316 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 NTHL1P78549 312 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 PRKG2Q13237 762 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 NFYCQ13952 458 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 GRM2Q14416 872 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 LCN8Q6JVE9 175 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 KIAA2013Q8IYS2 634 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 AHI1Q8N157 1196 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 OTUB2Q96DC9 234 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 PBX4Q9BYU1 374 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 ARMC1Q9NVT9 282 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 PDP2Q9P2J9 529 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 SUN2Q9UH99 717 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 MSRAQ9UJ68 235 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 ZMYM5Q9UJ78 669 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 AQP12BA6NM10 295 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 C5orf67F2Z3F1 127 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 NPPAP01160 153 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 OR56A5P0C7T3 313 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 ZCCHC18P0CG32 403 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 G6PDP11413 515 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 CAMK1Q14012 370 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 NR6A1Q15406 480 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 AP5B1Q2VPB7 878 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 TIGD2Q4W5G0 525 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 AQP12AQ8IXF9 295 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 MARVELD2Q8N4S9 558 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 DPP10Q8N608 796 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 GOLM1Q8NBJ4 401 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 LRTOMTQ8WZ04 291 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 SLC2A11Q9BYW1 496 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 WNT6Q9Y6F9 365 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 TSPAN11A1L157 253 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 RB1P06400 928 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 EBLN1P0CF75 366 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 EPCAMP16422 314 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 GGT5P36269 586 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 GRIA3P42263 894 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 PDK3Q15120 406 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 CYP20A1Q6UW02 462 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 UGT2A3Q6UWM9 527 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 PHC3Q8NDX5 983 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 HEPHQ9BQS7 1158 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 CERS4Q9HA82 394 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 PKD2L2Q9NZM6 624 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 SLAMF8Q9P0V8 285 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 TRPS1Q9UHF7 1281 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 PDE10AQ9Y233 779 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 NUAK1O60285 661 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC13A3-204ENST00000413164 STK16O75716 305 aa20.46■□□□□ 0.87
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