RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC187A0A096LP49 1063 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ESYT3A0FGR9 886 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 MAGEB16A2A368 324 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 FAM187AA6NFU0 413 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 A8MU76 341 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CFAP99D6REC4 459 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 E7ESA3 106 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 AP3B1O00203 1094 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 BTN3A3O00478 584 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 EFSO43281 561 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PRAMEF10O60809 474 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 NIPSNAP2O75323 286 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PIAS1O75925 651 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 DXOO77932 396 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 URI1O94763 535 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 UBXN7O94888 489 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 HAUS5O94927 633 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SLCO2B1O94956 709 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 C9P02748 559 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 AHSGP02765 367 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 RALBP11234 206 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SLC2A4P14672 509 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 OGNP20774 298 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ITPKBP27987 946 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ECHS1P30084 290 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ELK3P41970 407 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SLC1A2P43004 574 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ABCG1P45844 678 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 MAPK9P45984 424 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CD151P48509 253 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TTPAP49638 278 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CLCN7P51798 805 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 EPHA4P54764 986 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 INHBCP55103 352 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ADARP55265 1226 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 GPX6P59796 221 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SH3BP2P78314 561 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 GABREP78334 506 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 GPLD1P80108 840 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SARNPP82979 210 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 GUCY2DQ02846 1103 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 RPA4Q13156 261 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PRKG2Q13237 762 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 LAMB3Q13751 1172 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CRYMQ14894 314 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ST3GAL2Q16842 350 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TBC1D25Q3MII6 688 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 BBS9Q3SYG4 887 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 MAP9Q49MG5 647 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CCSMST1Q4G0I0 132 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ACSBG2Q5FVE4 666 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SNAP47Q5SQN1 464 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ARMC3Q5W041 872 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF470Q6ECI4 717 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CASC4Q6P4E1 433 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CNSTQ6PJW8 725 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 IGF2-ASQ6U949 168 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CYHR1Q6ZMK1 362 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 UNC5AQ6ZN44 842 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 FAM92BQ6ZTR7 304 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 RAB11FIP2Q7L804 512 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PCGF5Q86SE9 256 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PDZD3Q86UT5 571 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 PIM3Q86V86 326 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ANKMY2Q8IV38 441 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 RASGRP3Q8IV61 690 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 CNTN4Q8IWV2 1026 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 FAM20CQ8IXL6 584 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 SLC22A15Q8IZD6 547 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 FBXO39Q8N4B4 442 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ACVR1CQ8NER5 493 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 OR4E2Q8NGC2 313 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 OR4D9Q8NGE8 314 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 OR5AR1Q8NGP9 310 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 WDR48Q8TAF3 677 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 DENND1AQ8TEH3 1009 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 HEXDCQ8WVB3 486 aa3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNORD17-201ENST00000390930 KLHL6Q8WZ60 621 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms