RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357008.6

CHD4-201, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHD4, Length 6,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4-201ENST00000357008 GPR142Q7Z601 462 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 ATCAYQ86WG3 371 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 MTRRQ9UBK8 725 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 CFL2Q9Y281 166 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 UGT1A9O60656 530 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 PRKD3O94806 890 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 UGT1A6P19224 532 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 UGT1A1P22309 533 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 UGT1A4P22310 534 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 UGT1A3P35503 534 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 CBX5P45973 191 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 TMEM44Q2T9K0 475 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 CPNE9Q8IYJ1 553 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 TTPALQ9BTX7 342 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 UGT1A7Q9HAW7 530 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 UGT1A10Q9HAW8 530 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 UGT1A8Q9HAW9 530 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 PPM1HQ9ULR3 514 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 IMPDH1P20839 514 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 TIGD6Q17RP2 521 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 TAC4Q86UU9 113 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 XKRYO14609 159 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 OR1D2P34982 312 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 IL10RBQ08334 325 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 DPYSL2Q16555 572 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 FAM91A1Q658Y4 838 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 OR10G6Q8NH81 332 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 DNASE1L2Q92874 299 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 DMRTB1Q96MA1 342 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 CNTN3Q9P232 1028 aa14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 IQCF5A8MTL0 148 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 GPR25O00155 361 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 ZNF311Q5JNZ3 666 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 GPR153Q6NV75 609 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 PARGQ86W56 976 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 HID1Q8IV36 788 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 RNF31Q96EP0 1072 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 EHD1Q9H4M9 534 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 UPB1Q9UBR1 384 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 KRT33AO76009 404 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 CYP11A1P05108 521 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 HERVK_113P63132 956 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 HMCESQ96FZ2 354 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 ERVK-6Q9BXR3 956 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 TRIM2Q9C040 744 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 SLC22A4Q9H015 551 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 MAF1Q9H063 256 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 C8GP07360 202 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 IQCCQ4KMZ1 466 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 CANT1Q8WVQ1 401 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 SLC9A6Q92581 669 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 MAGEE1Q9HCI5 957 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 OAZ3Q9UMX2 235 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 TMEM198Q66K66 360 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 EBPLQ9BY08 206 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 PCP4L1A6NKN8 68 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 TSPAN1O60635 241 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 GABRR2P28476 465 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 GPD2P43304 727 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 PITPNAQ00169 270 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 DUSP28Q4G0W2 176 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 SLC9A4Q6AI14 798 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 BRINP2Q9C0B6 783 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 FAM83DQ9H4H8 585 aa14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 AP1S1P61966 158 aa14.62□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 PIGKQ92643 395 aa14.62□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 ACBD6Q9BR61 282 aa14.62□□□□□ -0.07
CHD4-201ENST00000357008 AOC1P19801 751 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms