RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355560.4

CLK2-201, Transcript of CDC like kinase 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CLK2, Length 2,120 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2-201ENST00000355560 OR4F6Q8NGB9 312 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 ASB11Q8WXH4 323 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 SLC12A9Q9BXP2 914 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CD248Q9HCU0 757 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 TMEM202A6NGA9 273 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 K7ESM1 405 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 VPS4BO75351 444 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 HGFP14210 728 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 PRLHRP49683 370 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 STX1BP61266 288 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CNTN1Q12860 1018 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 AGKQ53H12 422 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 RAET1GQ6H3X3 334 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 SNX31Q8N9S9 440 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 KYQ8NBH2 561 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 HDAC8Q9BY41 377 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 ZNF576Q9H609 170 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 PARVBQ9HBI1 364 aa25.18■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 ATG13O75143 517 aa25.17■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CAPN1P07384 714 aa25.17■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 LBPP18428 481 aa25.17■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 MTHFRP42898 656 aa25.17■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 ATP4BP51164 291 aa25.17■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CCNG1P51959 295 aa25.17■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 TRAF3Q13114 568 aa25.17■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 TMEM52BQ4KMG9 183 aa25.17■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 XKR7Q5GH72 579 aa25.17■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 ZNF765Q7L2R6 523 aa25.17■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 MAGEC3Q8TD91 643 aa25.17■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa25.17■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 L3MBTL1Q9Y468 752 aa25.17■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa25.17■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 KATNA1O75449 491 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 SP140Q13342 867 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 MAPRE2Q15555 327 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 KIF19Q2TAC6 998 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 FAM46CQ5VWP2 391 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 SCIMPQ6UWF3 145 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 OR9I1Q8NGQ6 314 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 METTL6Q8TCB7 284 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CXorf40AQ8TE69 158 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 TRIM54Q9BYV2 358 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 K7EPI3 171 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 HIST1H2ADP20671 130 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 GPR1P46091 355 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 SYTL3Q4VX76 610 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 C6orf163Q5TEZ5 329 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 C16orf89Q6UX73 402 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 MTSS1LQ765P7 747 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 TRIM74Q86UV6 250 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 DSELQ8IZU8 1212 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 HIST1H2AJQ99878 128 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 H2AFJQ9BTM1 129 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 EFCAB1Q9HAE3 211 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 PFDN4Q9NQP4 134 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 ST14Q9Y5Y6 855 aa25.16■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CHUKO15111 745 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 STK16O75716 305 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 PDE5AO76074 875 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 SLCO2B1O94956 709 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CDKL1Q00532 357 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 ENPP2Q13822 863 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CDKL4Q5MAI5 379 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 C1orf146Q5VVC0 180 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 NEK10Q6ZWH5 1172 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 RAB7BQ96AH8 199 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 FADS3Q9Y5Q0 445 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 H0Y3Z8 333 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 GFYI3L273 518 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 LTBRP36941 435 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 GALK1P51570 392 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 TMEM220Q6QAJ8 160 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 PAOXQ6QHF9 649 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 MILR1Q7Z6M3 343 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 OR2T11Q8NH01 316 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 TMEM159Q96B96 161 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 NPAS2Q99743 824 aa25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CKAP5Q14008 2032 aa25.14■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 EYSQ5T1H1 3165 aa25.14■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 SLC16A5O15375 505 aa25.14■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 PRR35P0CG20 571 aa25.14■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 CYP2A7P20853 494 aa25.14■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 BMP8BP34820 402 aa25.14■■□□□ 1.62
CLK2-201ENST00000355560 DRD3P35462 400 aa25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms