RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 EVPLLA8MZ36 301 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 CYBBP04839 570 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 FGF4P08620 206 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 CHRNA4P43681 627 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 OR2B6P58173 313 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 PURAQ00577 322 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 HECTD2Q5U5R9 776 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 CES5AQ6NT32 575 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 CXCL17Q6UXB2 119 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 PIM3Q86V86 326 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 GALNT12Q8IXK2 581 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 SLC38A6Q8IZM9 456 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 PSD4Q8NDX1 1056 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 OR52K2Q8NGK3 314 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 PTERQ96BW5 349 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ATXN3LQ9H3M9 355 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 PLSCR3Q9NRY6 295 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 FAM105AQ9NUU6 356 aa16.56■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TTC3P53804 2025 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 METTL15A6NJ78 407 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 GGT5P36269 586 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 CLK1P49759 484 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 SLC35A2P78381 396 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 DENND5AQ6IQ26 1287 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 SH3RF2Q8TEC5 729 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 KCTD13Q8WZ19 329 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 VAT1Q99536 393 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 HAT1O14929 419 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 PRKD3O94806 890 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 PAMP19021 973 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 RYKP34925 604 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 HTR3AP46098 478 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TUFMP49411 452 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 BRMS1LQ5PSV4 323 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TPRG1LQ5T0D9 272 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 LAIR1Q6GTX8 287 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ZNF544Q6NX49 715 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 HID1Q8IV36 788 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 PARP16Q8N5Y8 322 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ELMO1Q92556 727 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 CYP2S1Q96SQ9 504 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TREX1Q9NSU2 369 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 AIG1Q9NVV5 245 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 FBXL12Q9NXK8 326 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 MOSPD1Q9UJG1 213 aa16.55■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 CENPXA8MT69 81 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 SLC22A3O75751 556 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 THP07101 528 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TGFBR2P37173 567 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 FCGRTP55899 365 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 NEK5Q6P3R8 708 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 BNIPLQ7Z465 357 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 MICU2Q8IYU8 434 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 DUSP21Q9H596 190 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 PRDM8Q9NQV8 689 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ZW10O43264 779 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 CLCN5P51795 746 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 GNASQ5JWF2 1037 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 NXNL2Q5VZ03 156 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 PNCKQ6P2M8 343 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 SVOPLQ8N434 492 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 PYCR2Q96C36 320 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TSPAN17Q96FV3 270 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ZFYVE19Q96K21 471 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 CEP295NLQ96MC4 621 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ACOT13Q9NPJ3 140 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 U3KQV3 271 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TSC2P49815 1807 aa16.54■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 M0QZ92 97 aa16.53■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 AP3D1O14617 1153 aa16.53■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 KATNA1O75449 491 aa16.53■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 LCKP06239 509 aa16.53■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 DBTP11182 482 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 GGT1P19440 569 aa16.53■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 IFNA8P32881 189 aa16.53■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 CDKN2DP55273 166 aa16.53■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 HUNKP57058 714 aa16.53■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 PFKFB4Q16877 469 aa16.53■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 SPERTQ8NA61 448 aa16.53■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 FBLIM1Q8WUP2 373 aa16.53■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TTYH2Q9BSA4 534 aa16.53■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 CLPBQ9H078 707 aa16.53■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 TPRKBQ9Y3C4 175 aa16.53■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 ARL5CA6NH57 179 aa16.53■□□□□ 0.24
GDE1-201ENST00000353258 MITFO75030 526 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms