RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 ARMC12Q5T9G4 340 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 C16orf87Q6PH81 154 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 CYP20A1Q6UW02 462 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 DLEU7Q6UYE1 221 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 PAF1Q8N7H5 531 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 CYGBQ8WWM9 190 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 MYO19Q96H55 970 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 HAUS8Q9BT25 410 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 ASB8Q9H765 288 aa16.1■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 PGLSO95336 258 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 CLDN7O95471 211 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 GPIP06744 558 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 RFC2P35250 354 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 EMX2Q04743 252 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 PHKG1Q16816 387 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 OFCC1Q8IZS5 231 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 AUTS2Q8WXX7 1259 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 ALG14Q96F25 216 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 IGSF21Q96ID5 467 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 CLPBQ9H078 707 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 MAGEE1Q9HCI5 957 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 ANAPC2Q9UJX6 822 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 BACE2Q9Y5Z0 518 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 ABLIM3O94929 683 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 ALDH3B2P48448 385 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 CDH18Q13634 790 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 TXNDC8Q6A555 127 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 TBPL2Q6SJ96 375 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 STK40Q8N2I9 435 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 C9orf16Q9BUW7 83 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 IL26Q9NPH9 171 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 CLEC4EQ9ULY5 219 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 HOXA2O43364 376 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 SERPINB7O75635 380 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 TRAF3Q13114 568 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 PTGR1Q14914 329 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 SPRED1Q7Z699 444 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 HID1Q8IV36 788 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 PACRGLQ8N7B6 248 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 RNF145Q96MT1 663 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 SELENONQ9NZV5 590 aa16.09■□□□□ 0.17
SHQ1-201ENST00000325599 ANKRD28O15084 1053 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 RASAL1O95294 804 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 ADRM1Q16186 407 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 SLC36A3Q495N2 470 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 GLYATQ6IB77 296 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 BORAQ6PGQ7 559 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 MILR1Q7Z6M3 343 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 ABCG8Q9H221 673 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 TNKS2Q9H2K2 1166 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 TLR9Q9NR96 1032 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 HEBP1Q9NRV9 189 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 GREM1O60565 184 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 SLC2A4P14672 509 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 GGT5P36269 586 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 SGO1Q5FBB7 561 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 GOLM1Q8NBJ4 401 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 VPS50Q96JG6 964 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 EGFL8Q99944 293 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 CHID1Q9BWS9 393 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 LRRC3Q9BY71 257 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 SLC8A2Q9UPR5 921 aa16.08■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 DYTNA2CJ06 578 aa16.07■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 SNAP29O95721 258 aa16.07■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 MYF6P23409 242 aa16.07■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 HMOX2P30519 316 aa16.07■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 HNF1BP35680 557 aa16.07■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 TMED10P49755 219 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 RPL38P63173 70 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 HMGCS1Q01581 520 aa16.07■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 NFATC2Q13469 925 aa16.07■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa16.07■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 DTWD1Q8N5C7 304 aa16.07■□□□□ 0.16
SHQ1-201ENST00000325599 GIPC3Q8TF64 312 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms