RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270722.9

PRDM16-201, Transcript of PR/SET domain 16, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM16, Length 8,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM16-201ENST00000270722 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 PPA2Q9H2U2 334 aa13.1□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 DISC1C4P0D8 188 aa13.1□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 MAP3K6O95382 1288 aa13.1□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 NAT1P18440 290 aa13.1□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 PPP2R2BQ00005 443 aa13.1□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 GHRHRQ02643 423 aa13.1□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa13.1□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 SPARTQ8N0X7 666 aa13.1□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 A0A075B6Q4 140 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 PRORSD1PA6NEY8 169 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 GABRR2P28476 465 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 CLEC10AQ8IUN9 316 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 SLA2Q9H6Q3 261 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 ARL8BQ9NVJ2 186 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 GSC2O15499 205 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 POP4O95707 220 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 HK1P19367 917 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 CAV3P56539 151 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 NCS1P62166 190 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 OTOP3Q7RTS5 596 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 PIGXQ8TBF5 258 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 CAMK1GQ96NX5 476 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 TUBG2Q9NRH3 451 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 ASB3Q9Y575 518 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 ZNF726A6NNF4 738 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 TRBC1P01850 177 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 AMPD1P23109 780 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 KIR3DL1P43629 444 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 E2F2Q14209 437 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 HIPK1Q86Z02 1210 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 POC1BQ8TC44 478 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 SNX33Q8WV41 574 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 OVCA2Q8WZ82 227 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 SLC37A4O43826 429 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 MAFKO60675 156 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 ECT2LQ008S8 904 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 FOLH1Q04609 750 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 MAU2Q9Y6X3 613 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 EPHX1P07099 455 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 MTF1Q14872 753 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 LIN52Q52LA3 116 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 PAMR1Q6UXH9 720 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 OR4A15Q8NGL6 344 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 AGAP11Q8TF27 550 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 TAS2R3Q9NYW6 316 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 TRIM38O00635 465 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 WNT10BO00744 389 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 TACSTD2P09758 323 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 CD40LGP29965 261 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 PER3P56645 1201 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 ORC1Q13415 861 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 CA9Q16790 459 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 LDLRAP1Q5SW96 308 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 LIPMQ5VYY2 423 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 MED30Q96HR3 178 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 MOB1AQ9H8S9 216 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 PLK2Q9NYY3 685 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 B3GALT2O43825 422 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 GSCP56915 257 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 DSG2Q14126 1118 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 ZNF540Q8NDQ6 660 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 OR14C36Q8NHC7 312 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 MFSD14AQ96MC6 490 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 EPYCQ99645 322 aa13.09□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 FADS2P1A8MWK0 482 aa13.08□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa13.08□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 OR1I1O60431 355 aa13.08□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 SCNN1GP51170 649 aa13.08□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP13.08□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 DUPD1Q68J44 220 aa13.08□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 ASB18Q6ZVZ8 466 aa13.08□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 TBC1D21Q8IYX1 336 aa13.08□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 TSTD1Q8NFU3 115 aa13.08□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 PPTC7Q8NI37 304 aa13.08□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 COG5Q9UP83 839 aa13.08□□□□□ -0.31
PRDM16-201ENST00000270722 ITGA2BP08514 1039 aa13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms