RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261647.9

TTC19-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC19, Length 3,002 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19-201ENST00000261647 NR6A1Q15406 480 aa18.5■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa18.5■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 GALNT7Q86SF2 657 aa18.5■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 PJA1Q8NG27 643 aa18.5■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 CTRCQ99895 268 aa18.5■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa18.5■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 A0A1W2PQH9 124 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 TTC34A8MYJ7 566 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 B3GALT4O96024 378 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 EPHA2P29317 976 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 ACVRL1P37023 503 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 METTL6Q8TCB7 284 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 NCLNQ969V3 563 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 DACH2Q96NX9 599 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 CD274Q9NZQ7 290 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 SEC24AO95486 1093 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 MLYCDO95822 493 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 DLGAP3O95886 979 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 GABARAPL2P60520 117 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 PTPRNQ16849 979 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 DPP10Q8N608 796 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 CLHC1Q8NHS4 586 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 ZBED2Q9BTP6 218 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 E2F3O00716 465 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 BCKDKO14874 412 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 RPP40O75818 363 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 DIRAS1O95057 198 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 TBX18O95935 607 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 C1QCP02747 245 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 MT-ND2P03891 347 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 CYP2C18P33260 490 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 DGUOKQ16854 277 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 AP5B1Q2VPB7 878 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 GCNT7Q6ZNI0 430 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 CYP4Z1Q86W10 505 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 UGT2B28Q9BY64 529 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 DERL2Q9GZP9 239 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 RIBC2Q9H4K1 309 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 SPO11Q9Y5K1 396 aa18.49■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 HPRP00739 348 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 CD40LGP29965 261 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 IFITM2Q01629 132 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 RAD51Q06609 339 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 PWP1Q13610 501 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 ABRAXAS2Q15018 415 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 BRMS1LQ5PSV4 323 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 P2RY8Q86VZ1 359 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 MSRB3Q8IXL7 192 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 S100ZQ8WXG8 99 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 IGSF8Q969P0 613 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 PYCR2Q96C36 320 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 MYEOVQ96EZ4 313 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 TAS2R13Q9NYV9 303 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 ANKRD28O15084 1053 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 TBX1O43435 398 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 HMBSP08397 361 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 VAC14Q08AM6 782 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 GRIK2Q13002 908 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 PON2Q15165 354 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 MILR1Q7Z6M3 343 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 NETO1Q8TDF5 533 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 YIPF6Q96EC8 236 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 KLHL3Q9UH77 587 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa18.48■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 RRN3P2A6NIE6 340 aa18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 LCKP06239 509 aa18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 GBX1Q14549 363 aa18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 DUSP28Q4G0W2 176 aa18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 COLEC12Q5KU26 742 aa18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 AKAP14Q86UN6 197 aa18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 PIANPQ8IYJ0 282 aa18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 PIK3C3Q8NEB9 887 aa18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 OR4K2Q8NGD2 314 aa18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 OR56A4Q8NGH8 313 aa18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 ZFP14Q9HCL3 533 aa18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 RASSF1Q9NS23 344 aa18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 LCHNA4D1U4 455 aa18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 CXCR6O00574 342 aa18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 FFAR3O14843 346 aa18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 GPR42O15529 346 aa18.47■□□□□ 0.55
TTC19-201ENST00000261647 GSNP06396 782 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms